Protein–RNA interactions for Protein: P28301

Lox, Protein-lysine 6-oxidase, mousemouse

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LoxP28301 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
LoxP28301 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LoxP28301 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LoxP28301 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LoxP28301 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LoxP28301 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LoxP28301 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LoxP28301 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LoxP28301 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LoxP28301 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LoxP28301 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LoxP28301 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LoxP28301 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LoxP28301 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.31
LoxP28301 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LoxP28301 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LoxP28301 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LoxP28301 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LoxP28301 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LoxP28301 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LoxP28301 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
LoxP28301 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LoxP28301 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LoxP28301 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LoxP28301 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LoxP28301 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LoxP28301 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LoxP28301 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LoxP28301 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LoxP28301 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LoxP28301 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
LoxP28301 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LoxP28301 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LoxP28301 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
LoxP28301 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
LoxP28301 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
LoxP28301 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
LoxP28301 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
LoxP28301 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
LoxP28301 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LoxP28301 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LoxP28301 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LoxP28301 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LoxP28301 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LoxP28301 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LoxP28301 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LoxP28301 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LoxP28301 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LoxP28301 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LoxP28301 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LoxP28301 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LoxP28301 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LoxP28301 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LoxP28301 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LoxP28301 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LoxP28301 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LoxP28301 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LoxP28301 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LoxP28301 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LoxP28301 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LoxP28301 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LoxP28301 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LoxP28301 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LoxP28301 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LoxP28301 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LoxP28301 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LoxP28301 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LoxP28301 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LoxP28301 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LoxP28301 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LoxP28301 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
LoxP28301 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LoxP28301 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LoxP28301 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LoxP28301 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LoxP28301 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LoxP28301 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LoxP28301 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LoxP28301 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LoxP28301 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LoxP28301 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LoxP28301 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LoxP28301 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LoxP28301 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LoxP28301 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LoxP28301 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LoxP28301 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LoxP28301 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LoxP28301 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LoxP28301 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LoxP28301 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LoxP28301 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LoxP28301 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
LoxP28301 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LoxP28301 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LoxP28301 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LoxP28301 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LoxP28301 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LoxP28301 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LoxP28301 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.8 ms