Protein–RNA interactions for Protein: P28235

Gja4, Gap junction alpha-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja4P28235 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gja4P28235 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gja4P28235 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gja4P28235 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gja4P28235 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gja4P28235 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gja4P28235 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gja4P28235 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gja4P28235 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gja4P28235 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gja4P28235 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gja4P28235 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gja4P28235 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gja4P28235 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gja4P28235 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gja4P28235 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gja4P28235 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gja4P28235 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gja4P28235 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gja4P28235 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gja4P28235 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gja4P28235 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gja4P28235 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gja4P28235 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gja4P28235 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gja4P28235 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gja4P28235 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gja4P28235 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gja4P28235 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gja4P28235 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gja4P28235 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gja4P28235 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gja4P28235 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gja4P28235 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gja4P28235 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gja4P28235 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gja4P28235 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gja4P28235 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gja4P28235 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gja4P28235 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gja4P28235 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gja4P28235 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gja4P28235 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gja4P28235 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gja4P28235 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gja4P28235 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gja4P28235 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gja4P28235 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gja4P28235 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gja4P28235 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gja4P28235 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gja4P28235 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gja4P28235 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gja4P28235 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gja4P28235 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gja4P28235 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gja4P28235 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gja4P28235 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gja4P28235 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gja4P28235 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gja4P28235 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gja4P28235 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gja4P28235 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gja4P28235 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gja4P28235 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gja4P28235 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gja4P28235 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gja4P28235 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gja4P28235 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gja4P28235 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gja4P28235 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gja4P28235 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gja4P28235 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gja4P28235 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gja4P28235 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gja4P28235 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gja4P28235 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gja4P28235 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gja4P28235 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gja4P28235 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gja4P28235 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gja4P28235 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gja4P28235 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gja4P28235 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gja4P28235 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gja4P28235 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gja4P28235 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gja4P28235 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gja4P28235 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gja4P28235 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gja4P28235 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gja4P28235 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gja4P28235 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gja4P28235 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gja4P28235 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gja4P28235 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gja4P28235 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gja4P28235 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gja4P28235 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gja4P28235 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms