Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gjb1P28230 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gjb1P28230 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gjb1P28230 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gjb1P28230 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gjb1P28230 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gjb1P28230 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gjb1P28230 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gjb1P28230 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gjb1P28230 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gjb1P28230 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gjb1P28230 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gjb1P28230 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gjb1P28230 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gjb1P28230 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gjb1P28230 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gjb1P28230 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gjb1P28230 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gjb1P28230 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gjb1P28230 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gjb1P28230 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Gjb1P28230 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Gjb1P28230 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gjb1P28230 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Gjb1P28230 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gjb1P28230 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gjb1P28230 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gjb1P28230 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gjb1P28230 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gjb1P28230 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gjb1P28230 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gjb1P28230 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gjb1P28230 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gjb1P28230 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gjb1P28230 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gjb1P28230 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gjb1P28230 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Gjb1P28230 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gjb1P28230 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gjb1P28230 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gjb1P28230 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gjb1P28230 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gjb1P28230 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Gjb1P28230 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gjb1P28230 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gjb1P28230 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gjb1P28230 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gjb1P28230 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gjb1P28230 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Gjb1P28230 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gjb1P28230 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gjb1P28230 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gjb1P28230 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gjb1P28230 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gjb1P28230 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gjb1P28230 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gjb1P28230 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gjb1P28230 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gjb1P28230 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gjb1P28230 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gjb1P28230 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gjb1P28230 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Gjb1P28230 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gjb1P28230 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gjb1P28230 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gjb1P28230 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gjb1P28230 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Gjb1P28230 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gjb1P28230 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gjb1P28230 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gjb1P28230 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gjb1P28230 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gjb1P28230 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gjb1P28230 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gjb1P28230 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gjb1P28230 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gjb1P28230 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gjb1P28230 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gjb1P28230 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gjb1P28230 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gjb1P28230 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gjb1P28230 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gjb1P28230 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gjb1P28230 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gjb1P28230 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gjb1P28230 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gjb1P28230 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gjb1P28230 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gjb1P28230 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gjb1P28230 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gjb1P28230 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gjb1P28230 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gjb1P28230 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gjb1P28230 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gjb1P28230 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gjb1P28230 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gjb1P28230 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gjb1P28230 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gjb1P28230 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gjb1P28230 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms