Protein–RNA interactions for Protein: P27661

H2afx, Histone H2AX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afxP27661 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
H2afxP27661 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
H2afxP27661 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
H2afxP27661 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
H2afxP27661 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
H2afxP27661 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
H2afxP27661 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
H2afxP27661 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
H2afxP27661 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
H2afxP27661 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
H2afxP27661 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
H2afxP27661 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
H2afxP27661 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
H2afxP27661 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
H2afxP27661 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
H2afxP27661 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
H2afxP27661 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
H2afxP27661 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2afxP27661 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2afxP27661 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2afxP27661 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2afxP27661 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2afxP27661 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2afxP27661 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2afxP27661 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2afxP27661 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2afxP27661 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2afxP27661 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2afxP27661 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2afxP27661 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2afxP27661 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2afxP27661 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2afxP27661 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
H2afxP27661 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2afxP27661 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
H2afxP27661 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2afxP27661 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2afxP27661 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2afxP27661 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2afxP27661 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2afxP27661 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2afxP27661 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2afxP27661 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2afxP27661 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2afxP27661 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2afxP27661 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2afxP27661 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2afxP27661 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2afxP27661 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2afxP27661 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2afxP27661 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2afxP27661 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2afxP27661 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2afxP27661 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2afxP27661 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2afxP27661 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2afxP27661 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2afxP27661 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2afxP27661 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2afxP27661 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2afxP27661 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2afxP27661 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2afxP27661 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2afxP27661 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2afxP27661 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2afxP27661 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2afxP27661 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2afxP27661 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
H2afxP27661 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2afxP27661 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2afxP27661 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2afxP27661 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2afxP27661 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2afxP27661 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2afxP27661 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2afxP27661 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2afxP27661 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2afxP27661 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2afxP27661 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2afxP27661 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2afxP27661 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2afxP27661 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2afxP27661 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2afxP27661 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2afxP27661 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2afxP27661 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2afxP27661 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2afxP27661 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2afxP27661 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2afxP27661 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2afxP27661 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2afxP27661 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2afxP27661 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2afxP27661 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2afxP27661 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2afxP27661 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2afxP27661 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2afxP27661 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2afxP27661 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2afxP27661 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms