Protein–RNA interactions for Protein: P26231

Ctnna1, Catenin alpha-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna1P26231 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ctnna1P26231 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Ctnna1P26231 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ctnna1P26231 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ctnna1P26231 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ctnna1P26231 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ctnna1P26231 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ctnna1P26231 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ctnna1P26231 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ctnna1P26231 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ctnna1P26231 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ctnna1P26231 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ctnna1P26231 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ctnna1P26231 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ctnna1P26231 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ctnna1P26231 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ctnna1P26231 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ctnna1P26231 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ctnna1P26231 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ctnna1P26231 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ctnna1P26231 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ctnna1P26231 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ctnna1P26231 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ctnna1P26231 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ctnna1P26231 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ctnna1P26231 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ctnna1P26231 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ctnna1P26231 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ctnna1P26231 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Ctnna1P26231 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ctnna1P26231 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ctnna1P26231 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ctnna1P26231 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ctnna1P26231 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ctnna1P26231 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ctnna1P26231 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ctnna1P26231 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Ctnna1P26231 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ctnna1P26231 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ctnna1P26231 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ctnna1P26231 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ctnna1P26231 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ctnna1P26231 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ctnna1P26231 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ctnna1P26231 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ctnna1P26231 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ctnna1P26231 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ctnna1P26231 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ctnna1P26231 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ctnna1P26231 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ctnna1P26231 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ctnna1P26231 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ctnna1P26231 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ctnna1P26231 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ctnna1P26231 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ctnna1P26231 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ctnna1P26231 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ctnna1P26231 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ctnna1P26231 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ctnna1P26231 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ctnna1P26231 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctnna1P26231 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctnna1P26231 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctnna1P26231 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctnna1P26231 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctnna1P26231 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctnna1P26231 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctnna1P26231 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctnna1P26231 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctnna1P26231 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctnna1P26231 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctnna1P26231 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctnna1P26231 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctnna1P26231 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctnna1P26231 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctnna1P26231 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctnna1P26231 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctnna1P26231 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctnna1P26231 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctnna1P26231 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctnna1P26231 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctnna1P26231 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctnna1P26231 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctnna1P26231 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctnna1P26231 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctnna1P26231 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctnna1P26231 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctnna1P26231 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctnna1P26231 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctnna1P26231 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctnna1P26231 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctnna1P26231 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctnna1P26231 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctnna1P26231 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctnna1P26231 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctnna1P26231 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctnna1P26231 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ctnna1P26231 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ctnna1P26231 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ctnna1P26231 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms