Protein–RNA interactions for Protein: P23463

Hoxd8, Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8P23463 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxd8P23463 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxd8P23463 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxd8P23463 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxd8P23463 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxd8P23463 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxd8P23463 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxd8P23463 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxd8P23463 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxd8P23463 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxd8P23463 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxd8P23463 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxd8P23463 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxd8P23463 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxd8P23463 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxd8P23463 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxd8P23463 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxd8P23463 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxd8P23463 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxd8P23463 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxd8P23463 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxd8P23463 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxd8P23463 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxd8P23463 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxd8P23463 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxd8P23463 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxd8P23463 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxd8P23463 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxd8P23463 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxd8P23463 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxd8P23463 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxd8P23463 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxd8P23463 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxd8P23463 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxd8P23463 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxd8P23463 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxd8P23463 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxd8P23463 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxd8P23463 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxd8P23463 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxd8P23463 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxd8P23463 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxd8P23463 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxd8P23463 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxd8P23463 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxd8P23463 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxd8P23463 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxd8P23463 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxd8P23463 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxd8P23463 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxd8P23463 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxd8P23463 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxd8P23463 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxd8P23463 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxd8P23463 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxd8P23463 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxd8P23463 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxd8P23463 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxd8P23463 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hoxd8P23463 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hoxd8P23463 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hoxd8P23463 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hoxd8P23463 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hoxd8P23463 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hoxd8P23463 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hoxd8P23463 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Hoxd8P23463 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hoxd8P23463 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxd8P23463 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxd8P23463 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxd8P23463 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxd8P23463 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxd8P23463 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxd8P23463 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxd8P23463 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxd8P23463 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxd8P23463 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxd8P23463 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxd8P23463 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxd8P23463 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxd8P23463 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxd8P23463 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxd8P23463 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxd8P23463 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxd8P23463 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxd8P23463 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxd8P23463 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxd8P23463 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxd8P23463 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxd8P23463 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxd8P23463 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxd8P23463 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxd8P23463 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxd8P23463 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxd8P23463 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxd8P23463 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxd8P23463 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxd8P23463 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxd8P23463 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxd8P23463 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms