Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PparaP23204 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PparaP23204 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PparaP23204 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PparaP23204 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PparaP23204 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PparaP23204 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PparaP23204 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PparaP23204 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PparaP23204 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PparaP23204 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PparaP23204 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PparaP23204 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PparaP23204 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PparaP23204 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PparaP23204 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PparaP23204 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PparaP23204 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PparaP23204 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PparaP23204 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PparaP23204 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PparaP23204 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PparaP23204 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PparaP23204 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PparaP23204 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PparaP23204 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PparaP23204 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PparaP23204 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PparaP23204 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PparaP23204 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PparaP23204 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PparaP23204 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PparaP23204 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PparaP23204 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PparaP23204 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PparaP23204 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PparaP23204 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PparaP23204 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PparaP23204 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PparaP23204 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PparaP23204 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PparaP23204 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PparaP23204 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PparaP23204 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PparaP23204 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PparaP23204 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PparaP23204 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PparaP23204 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PparaP23204 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PparaP23204 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PparaP23204 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PparaP23204 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PparaP23204 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PparaP23204 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PparaP23204 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PparaP23204 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PparaP23204 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PparaP23204 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PparaP23204 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PparaP23204 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PparaP23204 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PparaP23204 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PparaP23204 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PparaP23204 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PparaP23204 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PparaP23204 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PparaP23204 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PparaP23204 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PparaP23204 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PparaP23204 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PparaP23204 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PparaP23204 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PparaP23204 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PparaP23204 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PparaP23204 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PparaP23204 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PparaP23204 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PparaP23204 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PparaP23204 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PparaP23204 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PparaP23204 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PparaP23204 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PparaP23204 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PparaP23204 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PparaP23204 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PparaP23204 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PparaP23204 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PparaP23204 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PparaP23204 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PparaP23204 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PparaP23204 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PparaP23204 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PparaP23204 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PparaP23204 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PparaP23204 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PparaP23204 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PparaP23204 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PparaP23204 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PparaP23204 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PparaP23204 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms