Protein–RNA interactions for Protein: P21107

Tpm3, Tropomyosin alpha-3 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3P21107 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tpm3P21107 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tpm3P21107 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tpm3P21107 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tpm3P21107 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tpm3P21107 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Tpm3P21107 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tpm3P21107 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tpm3P21107 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tpm3P21107 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tpm3P21107 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tpm3P21107 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tpm3P21107 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tpm3P21107 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tpm3P21107 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tpm3P21107 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tpm3P21107 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tpm3P21107 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tpm3P21107 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Tpm3P21107 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tpm3P21107 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tpm3P21107 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tpm3P21107 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tpm3P21107 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Tpm3P21107 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tpm3P21107 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tpm3P21107 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tpm3P21107 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tpm3P21107 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tpm3P21107 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tpm3P21107 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tpm3P21107 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tpm3P21107 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tpm3P21107 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tpm3P21107 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tpm3P21107 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tpm3P21107 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tpm3P21107 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tpm3P21107 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tpm3P21107 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tpm3P21107 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tpm3P21107 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tpm3P21107 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Tpm3P21107 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tpm3P21107 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tpm3P21107 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tpm3P21107 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tpm3P21107 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tpm3P21107 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tpm3P21107 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tpm3P21107 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tpm3P21107 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Tpm3P21107 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Tpm3P21107 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tpm3P21107 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tpm3P21107 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tpm3P21107 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tpm3P21107 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tpm3P21107 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tpm3P21107 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tpm3P21107 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tpm3P21107 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tpm3P21107 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tpm3P21107 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tpm3P21107 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tpm3P21107 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tpm3P21107 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tpm3P21107 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tpm3P21107 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tpm3P21107 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tpm3P21107 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tpm3P21107 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tpm3P21107 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tpm3P21107 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Tpm3P21107 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Tpm3P21107 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tpm3P21107 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tpm3P21107 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tpm3P21107 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tpm3P21107 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tpm3P21107 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tpm3P21107 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tpm3P21107 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tpm3P21107 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tpm3P21107 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tpm3P21107 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tpm3P21107 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tpm3P21107 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tpm3P21107 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tpm3P21107 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tpm3P21107 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tpm3P21107 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tpm3P21107 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Tpm3P21107 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tpm3P21107 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tpm3P21107 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tpm3P21107 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tpm3P21107 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tpm3P21107 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tpm3P21107 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms