Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PrkcaP20444 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
PrkcaP20444 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PrkcaP20444 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PrkcaP20444 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PrkcaP20444 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
PrkcaP20444 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PrkcaP20444 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PrkcaP20444 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PrkcaP20444 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PrkcaP20444 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PrkcaP20444 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PrkcaP20444 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PrkcaP20444 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PrkcaP20444 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PrkcaP20444 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PrkcaP20444 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PrkcaP20444 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PrkcaP20444 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PrkcaP20444 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PrkcaP20444 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PrkcaP20444 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PrkcaP20444 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PrkcaP20444 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PrkcaP20444 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PrkcaP20444 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PrkcaP20444 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PrkcaP20444 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PrkcaP20444 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PrkcaP20444 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PrkcaP20444 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PrkcaP20444 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
PrkcaP20444 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PrkcaP20444 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PrkcaP20444 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PrkcaP20444 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PrkcaP20444 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PrkcaP20444 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PrkcaP20444 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PrkcaP20444 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PrkcaP20444 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PrkcaP20444 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PrkcaP20444 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PrkcaP20444 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PrkcaP20444 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PrkcaP20444 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PrkcaP20444 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PrkcaP20444 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PrkcaP20444 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PrkcaP20444 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PrkcaP20444 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PrkcaP20444 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PrkcaP20444 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PrkcaP20444 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PrkcaP20444 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PrkcaP20444 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
PrkcaP20444 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PrkcaP20444 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PrkcaP20444 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PrkcaP20444 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PrkcaP20444 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PrkcaP20444 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PrkcaP20444 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PrkcaP20444 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PrkcaP20444 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PrkcaP20444 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
PrkcaP20444 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PrkcaP20444 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PrkcaP20444 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PrkcaP20444 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PrkcaP20444 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
PrkcaP20444 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PrkcaP20444 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PrkcaP20444 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PrkcaP20444 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PrkcaP20444 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PrkcaP20444 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PrkcaP20444 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PrkcaP20444 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PrkcaP20444 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PrkcaP20444 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PrkcaP20444 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PrkcaP20444 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PrkcaP20444 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PrkcaP20444 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PrkcaP20444 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PrkcaP20444 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PrkcaP20444 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PrkcaP20444 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
PrkcaP20444 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PrkcaP20444 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PrkcaP20444 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PrkcaP20444 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PrkcaP20444 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PrkcaP20444 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
PrkcaP20444 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PrkcaP20444 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PrkcaP20444 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PrkcaP20444 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PrkcaP20444 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms