Protein–RNA interactions for Protein: P20293

T, Brachyury protein, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP20293 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TP20293 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TP20293 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TP20293 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TP20293 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TP20293 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TP20293 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TP20293 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TP20293 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TP20293 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TP20293 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TP20293 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TP20293 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TP20293 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TP20293 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TP20293 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TP20293 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TP20293 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TP20293 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TP20293 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TP20293 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TP20293 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TP20293 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TP20293 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TP20293 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TP20293 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TP20293 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TP20293 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TP20293 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TP20293 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TP20293 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TP20293 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TP20293 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TP20293 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TP20293 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TP20293 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TP20293 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TP20293 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TP20293 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TP20293 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TP20293 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TP20293 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TP20293 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TP20293 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TP20293 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TP20293 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TP20293 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TP20293 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TP20293 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TP20293 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TP20293 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TP20293 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TP20293 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TP20293 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TP20293 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TP20293 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TP20293 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TP20293 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TP20293 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TP20293 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TP20293 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TP20293 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TP20293 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TP20293 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TP20293 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
TP20293 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TP20293 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TP20293 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TP20293 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TP20293 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TP20293 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TP20293 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TP20293 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TP20293 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TP20293 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TP20293 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TP20293 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TP20293 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TP20293 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TP20293 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TP20293 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TP20293 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TP20293 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TP20293 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TP20293 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TP20293 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TP20293 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TP20293 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TP20293 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TP20293 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TP20293 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TP20293 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TP20293 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TP20293 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TP20293 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TP20293 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TP20293 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TP20293 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TP20293 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TP20293 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms