Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PdgfaP20033 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PdgfaP20033 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PdgfaP20033 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PdgfaP20033 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PdgfaP20033 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PdgfaP20033 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PdgfaP20033 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PdgfaP20033 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PdgfaP20033 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PdgfaP20033 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PdgfaP20033 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PdgfaP20033 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PdgfaP20033 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PdgfaP20033 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PdgfaP20033 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PdgfaP20033 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PdgfaP20033 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PdgfaP20033 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PdgfaP20033 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PdgfaP20033 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PdgfaP20033 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PdgfaP20033 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PdgfaP20033 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PdgfaP20033 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PdgfaP20033 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PdgfaP20033 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PdgfaP20033 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PdgfaP20033 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PdgfaP20033 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PdgfaP20033 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PdgfaP20033 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PdgfaP20033 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PdgfaP20033 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PdgfaP20033 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PdgfaP20033 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PdgfaP20033 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PdgfaP20033 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PdgfaP20033 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PdgfaP20033 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PdgfaP20033 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PdgfaP20033 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PdgfaP20033 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PdgfaP20033 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PdgfaP20033 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PdgfaP20033 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PdgfaP20033 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PdgfaP20033 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PdgfaP20033 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PdgfaP20033 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PdgfaP20033 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PdgfaP20033 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PdgfaP20033 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PdgfaP20033 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PdgfaP20033 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PdgfaP20033 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PdgfaP20033 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PdgfaP20033 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PdgfaP20033 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PdgfaP20033 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PdgfaP20033 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PdgfaP20033 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PdgfaP20033 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PdgfaP20033 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PdgfaP20033 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PdgfaP20033 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PdgfaP20033 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PdgfaP20033 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PdgfaP20033 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PdgfaP20033 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PdgfaP20033 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PdgfaP20033 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PdgfaP20033 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PdgfaP20033 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PdgfaP20033 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PdgfaP20033 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PdgfaP20033 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PdgfaP20033 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PdgfaP20033 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PdgfaP20033 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PdgfaP20033 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PdgfaP20033 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PdgfaP20033 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PdgfaP20033 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PdgfaP20033 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PdgfaP20033 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PdgfaP20033 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PdgfaP20033 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PdgfaP20033 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PdgfaP20033 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PdgfaP20033 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PdgfaP20033 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PdgfaP20033 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PdgfaP20033 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PdgfaP20033 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PdgfaP20033 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PdgfaP20033 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PdgfaP20033 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PdgfaP20033 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PdgfaP20033 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms