Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NefhP19246 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NefhP19246 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NefhP19246 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NefhP19246 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NefhP19246 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NefhP19246 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NefhP19246 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NefhP19246 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NefhP19246 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NefhP19246 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NefhP19246 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NefhP19246 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
NefhP19246 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NefhP19246 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NefhP19246 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NefhP19246 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NefhP19246 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NefhP19246 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NefhP19246 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NefhP19246 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NefhP19246 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
NefhP19246 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NefhP19246 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NefhP19246 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NefhP19246 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NefhP19246 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NefhP19246 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NefhP19246 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NefhP19246 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NefhP19246 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NefhP19246 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
NefhP19246 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
NefhP19246 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
NefhP19246 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NefhP19246 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NefhP19246 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NefhP19246 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NefhP19246 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NefhP19246 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NefhP19246 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NefhP19246 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NefhP19246 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NefhP19246 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NefhP19246 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NefhP19246 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NefhP19246 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
NefhP19246 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NefhP19246 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NefhP19246 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
NefhP19246 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NefhP19246 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NefhP19246 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NefhP19246 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
NefhP19246 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NefhP19246 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NefhP19246 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NefhP19246 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NefhP19246 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NefhP19246 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NefhP19246 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NefhP19246 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NefhP19246 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NefhP19246 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NefhP19246 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
NefhP19246 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
NefhP19246 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NefhP19246 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NefhP19246 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NefhP19246 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NefhP19246 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NefhP19246 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
NefhP19246 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
NefhP19246 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
NefhP19246 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NefhP19246 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NefhP19246 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NefhP19246 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NefhP19246 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NefhP19246 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NefhP19246 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NefhP19246 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NefhP19246 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NefhP19246 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NefhP19246 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NefhP19246 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NefhP19246 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NefhP19246 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NefhP19246 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NefhP19246 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NefhP19246 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NefhP19246 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NefhP19246 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NefhP19246 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NefhP19246 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NefhP19246 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NefhP19246 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NefhP19246 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
NefhP19246 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
NefhP19246 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms