Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnnc1P19123 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnnc1P19123 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnnc1P19123 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnnc1P19123 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnnc1P19123 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnnc1P19123 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnnc1P19123 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnnc1P19123 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnnc1P19123 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnnc1P19123 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnnc1P19123 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnnc1P19123 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnnc1P19123 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnnc1P19123 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnnc1P19123 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnnc1P19123 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnnc1P19123 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnnc1P19123 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnnc1P19123 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnnc1P19123 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnnc1P19123 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnnc1P19123 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnnc1P19123 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnnc1P19123 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnnc1P19123 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnnc1P19123 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnnc1P19123 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnnc1P19123 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnnc1P19123 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnnc1P19123 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnnc1P19123 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnnc1P19123 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnnc1P19123 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnnc1P19123 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnnc1P19123 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnnc1P19123 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnnc1P19123 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnnc1P19123 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnnc1P19123 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnnc1P19123 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnnc1P19123 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnnc1P19123 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnnc1P19123 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnnc1P19123 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnnc1P19123 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnnc1P19123 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnnc1P19123 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnnc1P19123 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnnc1P19123 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnnc1P19123 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnnc1P19123 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnnc1P19123 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnnc1P19123 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnnc1P19123 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnnc1P19123 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnnc1P19123 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnnc1P19123 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnnc1P19123 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnnc1P19123 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnnc1P19123 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnnc1P19123 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnnc1P19123 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnnc1P19123 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnnc1P19123 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnnc1P19123 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnnc1P19123 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnnc1P19123 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnnc1P19123 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnnc1P19123 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnnc1P19123 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnnc1P19123 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnnc1P19123 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnnc1P19123 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnnc1P19123 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnnc1P19123 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnnc1P19123 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnnc1P19123 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnnc1P19123 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnnc1P19123 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnnc1P19123 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnnc1P19123 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnnc1P19123 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnnc1P19123 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnnc1P19123 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnnc1P19123 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnnc1P19123 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnnc1P19123 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnnc1P19123 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnnc1P19123 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnnc1P19123 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnnc1P19123 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnnc1P19123 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnnc1P19123 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnnc1P19123 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tnnc1P19123 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tnnc1P19123 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tnnc1P19123 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tnnc1P19123 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tnnc1P19123 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms