Protein–RNA interactions for Protein: P18533

Ig heavy chain V region 733, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18533 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P18533 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
P18533 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P18533 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P18533 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P18533 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P18533 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P18533 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
P18533 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P18533 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P18533 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
P18533 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P18533 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P18533 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P18533 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
P18533 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P18533 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P18533 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
P18533 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
P18533 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P18533 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P18533 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P18533 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
P18533 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
P18533 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
P18533 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P18533 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
P18533 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
P18533 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P18533 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P18533 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P18533 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P18533 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
P18533 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P18533 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P18533 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
P18533 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P18533 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P18533 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
P18533 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
P18533 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
P18533 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P18533 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
P18533 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P18533 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P18533 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
P18533 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P18533 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P18533 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
P18533 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P18533 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
P18533 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P18533 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
P18533 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P18533 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
P18533 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P18533 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P18533 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P18533 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P18533 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P18533 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P18533 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
P18533 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P18533 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P18533 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P18533 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P18533 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P18533 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P18533 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P18533 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P18533 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P18533 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P18533 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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P18533 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
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P18533 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P18533 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P18533 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P18533 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
P18533 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P18533 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
P18533 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P18533 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P18533 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P18533 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P18533 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P18533 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P18533 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P18533 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P18533 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P18533 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P18533 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P18533 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
P18533 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P18533 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P18533 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P18533 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P18533 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P18533 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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