Protein–RNA interactions for Protein: P18530

Ig heavy chain V region 7-39, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18530 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
P18530 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P18530 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P18530 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P18530 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P18530 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P18530 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P18530 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P18530 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P18530 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
P18530 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
P18530 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P18530 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P18530 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
P18530 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P18530 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P18530 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
P18530 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P18530 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
P18530 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P18530 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P18530 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
P18530 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P18530 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P18530 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
P18530 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P18530 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P18530 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
P18530 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P18530 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
P18530 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P18530 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P18530 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P18530 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P18530 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
P18530 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
P18530 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P18530 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P18530 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P18530 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P18530 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P18530 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P18530 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P18530 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P18530 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P18530 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P18530 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
P18530 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P18530 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P18530 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P18530 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P18530 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P18530 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P18530 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P18530 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P18530 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P18530 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P18530 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P18530 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P18530 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
P18530 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
P18530 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
P18530 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
P18530 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P18530 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
P18530 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P18530 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P18530 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P18530 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
P18530 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P18530 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P18530 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P18530 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P18530 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
P18530 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P18530 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P18530 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P18530 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P18530 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P18530 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P18530 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P18530 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P18530 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P18530 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P18530 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P18530 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P18530 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P18530 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P18530 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P18530 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P18530 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
P18530 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P18530 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P18530 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P18530 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P18530 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P18530 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
P18530 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P18530 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
P18530 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms