Protein–RNA interactions for Protein: P18529

Ig heavy chain V region 5-76, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18529 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P18529 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P18529 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P18529 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P18529 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P18529 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P18529 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P18529 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P18529 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P18529 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P18529 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P18529 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P18529 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P18529 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P18529 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P18529 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P18529 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18529 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18529 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18529 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18529 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18529 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18529 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18529 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18529 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18529 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18529 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18529 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18529 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18529 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18529 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18529 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18529 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18529 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18529 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18529 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18529 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18529 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18529 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18529 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
P18529 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18529 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18529 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18529 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18529 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18529 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18529 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18529 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18529 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18529 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18529 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18529 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18529 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18529 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18529 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18529 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18529 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18529 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
P18529 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18529 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18529 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18529 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18529 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18529 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18529 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18529 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18529 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18529 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18529 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18529 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18529 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18529 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18529 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18529 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18529 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18529 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18529 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18529 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18529 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18529 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18529 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18529 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18529 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18529 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18529 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18529 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18529 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18529 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18529 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18529 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18529 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
P18529 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18529 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18529 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18529 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18529 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18529 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18529 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18529 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
P18529 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms