Protein–RNA interactions for Protein: P14576

Srp54, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54P14576 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Srp54P14576 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Srp54P14576 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Srp54P14576 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Srp54P14576 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Srp54P14576 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Srp54P14576 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Srp54P14576 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Srp54P14576 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Srp54P14576 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Srp54P14576 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Srp54P14576 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Srp54P14576 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Srp54P14576 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Srp54P14576 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Srp54P14576 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Srp54P14576 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Srp54P14576 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Srp54P14576 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Srp54P14576 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Srp54P14576 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Srp54P14576 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Srp54P14576 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Srp54P14576 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Srp54P14576 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Srp54P14576 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Srp54P14576 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Srp54P14576 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Srp54P14576 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Srp54P14576 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Srp54P14576 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Srp54P14576 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Srp54P14576 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Srp54P14576 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Srp54P14576 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Srp54P14576 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Srp54P14576 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Srp54P14576 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Srp54P14576 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Srp54P14576 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Srp54P14576 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Srp54P14576 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Srp54P14576 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Srp54P14576 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Srp54P14576 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Srp54P14576 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Srp54P14576 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Srp54P14576 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Srp54P14576 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Srp54P14576 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Srp54P14576 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Srp54P14576 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Srp54P14576 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Srp54P14576 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Srp54P14576 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Srp54P14576 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Srp54P14576 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Srp54P14576 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Srp54P14576 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Srp54P14576 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Srp54P14576 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Srp54P14576 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Srp54P14576 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Srp54P14576 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Srp54P14576 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Srp54P14576 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Srp54P14576 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Srp54P14576 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Srp54P14576 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Srp54P14576 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Srp54P14576 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Srp54P14576 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Srp54P14576 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Srp54P14576 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Srp54P14576 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Srp54P14576 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Srp54P14576 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Srp54P14576 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Srp54P14576 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Srp54P14576 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Srp54P14576 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Srp54P14576 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Srp54P14576 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Srp54P14576 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Srp54P14576 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Srp54P14576 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Srp54P14576 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Srp54P14576 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Srp54P14576 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Srp54P14576 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Srp54P14576 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Srp54P14576 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Srp54P14576 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Srp54P14576 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Srp54P14576 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Srp54P14576 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Srp54P14576 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Srp54P14576 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Srp54P14576 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Srp54P14576 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms