Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.3 ms