Protein–RNA interactions for Protein: P09925

Surf1, Surfeit locus protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf1P09925 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Surf1P09925 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Surf1P09925 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Surf1P09925 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Surf1P09925 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Surf1P09925 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Surf1P09925 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Surf1P09925 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Surf1P09925 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Surf1P09925 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Surf1P09925 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Surf1P09925 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Surf1P09925 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Surf1P09925 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Surf1P09925 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Surf1P09925 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Surf1P09925 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Surf1P09925 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Surf1P09925 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Surf1P09925 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Surf1P09925 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Surf1P09925 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Surf1P09925 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Surf1P09925 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Surf1P09925 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Surf1P09925 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Surf1P09925 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Surf1P09925 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Surf1P09925 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Surf1P09925 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Surf1P09925 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Surf1P09925 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Surf1P09925 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Surf1P09925 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Surf1P09925 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Surf1P09925 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Surf1P09925 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Surf1P09925 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Surf1P09925 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Surf1P09925 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Surf1P09925 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Surf1P09925 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Surf1P09925 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Surf1P09925 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Surf1P09925 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Surf1P09925 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Surf1P09925 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Surf1P09925 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Surf1P09925 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Surf1P09925 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Surf1P09925 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Surf1P09925 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Surf1P09925 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Surf1P09925 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Surf1P09925 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Surf1P09925 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Surf1P09925 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Surf1P09925 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Surf1P09925 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Surf1P09925 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Surf1P09925 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Surf1P09925 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Surf1P09925 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Surf1P09925 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Surf1P09925 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Surf1P09925 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Surf1P09925 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Surf1P09925 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Surf1P09925 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Surf1P09925 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Surf1P09925 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Surf1P09925 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Surf1P09925 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Surf1P09925 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Surf1P09925 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Surf1P09925 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Surf1P09925 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Surf1P09925 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Surf1P09925 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Surf1P09925 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Surf1P09925 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Surf1P09925 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Surf1P09925 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Surf1P09925 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Surf1P09925 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Surf1P09925 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Surf1P09925 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Surf1P09925 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Surf1P09925 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Surf1P09925 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Surf1P09925 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Surf1P09925 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Surf1P09925 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Surf1P09925 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Surf1P09925 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Surf1P09925 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Surf1P09925 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Surf1P09925 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Surf1P09925 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Surf1P09925 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms