Protein–RNA interactions for Protein: P04202

Tgfb1, Transforming growth factor beta-1, mousemouse

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Length 390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb1P04202 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tgfb1P04202 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tgfb1P04202 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tgfb1P04202 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tgfb1P04202 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Tgfb1P04202 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tgfb1P04202 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tgfb1P04202 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Tgfb1P04202 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tgfb1P04202 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tgfb1P04202 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Tgfb1P04202 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tgfb1P04202 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tgfb1P04202 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tgfb1P04202 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tgfb1P04202 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tgfb1P04202 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tgfb1P04202 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tgfb1P04202 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tgfb1P04202 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tgfb1P04202 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tgfb1P04202 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tgfb1P04202 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tgfb1P04202 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tgfb1P04202 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tgfb1P04202 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tgfb1P04202 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tgfb1P04202 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tgfb1P04202 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Tgfb1P04202 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tgfb1P04202 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tgfb1P04202 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tgfb1P04202 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Tgfb1P04202 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Tgfb1P04202 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tgfb1P04202 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tgfb1P04202 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tgfb1P04202 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tgfb1P04202 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tgfb1P04202 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tgfb1P04202 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tgfb1P04202 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tgfb1P04202 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tgfb1P04202 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tgfb1P04202 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tgfb1P04202 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tgfb1P04202 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tgfb1P04202 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tgfb1P04202 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tgfb1P04202 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Tgfb1P04202 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tgfb1P04202 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tgfb1P04202 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tgfb1P04202 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tgfb1P04202 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tgfb1P04202 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tgfb1P04202 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tgfb1P04202 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tgfb1P04202 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tgfb1P04202 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tgfb1P04202 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tgfb1P04202 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tgfb1P04202 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tgfb1P04202 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Tgfb1P04202 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Tgfb1P04202 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgfb1P04202 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgfb1P04202 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgfb1P04202 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgfb1P04202 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgfb1P04202 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgfb1P04202 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgfb1P04202 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgfb1P04202 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgfb1P04202 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgfb1P04202 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgfb1P04202 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgfb1P04202 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgfb1P04202 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgfb1P04202 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgfb1P04202 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgfb1P04202 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgfb1P04202 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgfb1P04202 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgfb1P04202 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgfb1P04202 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgfb1P04202 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgfb1P04202 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgfb1P04202 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgfb1P04202 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgfb1P04202 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgfb1P04202 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgfb1P04202 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgfb1P04202 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgfb1P04202 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgfb1P04202 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgfb1P04202 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgfb1P04202 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgfb1P04202 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgfb1P04202 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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