Protein–RNA interactions for Protein: O89110

Casp8, Caspase-8, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp8O89110 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Casp8O89110 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Casp8O89110 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Casp8O89110 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Casp8O89110 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Casp8O89110 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Casp8O89110 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Casp8O89110 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Casp8O89110 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Casp8O89110 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Casp8O89110 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Casp8O89110 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Casp8O89110 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Casp8O89110 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Casp8O89110 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Casp8O89110 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Casp8O89110 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Casp8O89110 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Casp8O89110 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Casp8O89110 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Casp8O89110 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Casp8O89110 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Casp8O89110 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Casp8O89110 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Casp8O89110 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Casp8O89110 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Casp8O89110 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Casp8O89110 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Casp8O89110 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Casp8O89110 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Casp8O89110 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Casp8O89110 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Casp8O89110 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Casp8O89110 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Casp8O89110 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Casp8O89110 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Casp8O89110 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Casp8O89110 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Casp8O89110 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Casp8O89110 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Casp8O89110 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Casp8O89110 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Casp8O89110 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Casp8O89110 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Casp8O89110 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Casp8O89110 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Casp8O89110 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Casp8O89110 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Casp8O89110 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Casp8O89110 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Casp8O89110 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Casp8O89110 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Casp8O89110 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Casp8O89110 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Casp8O89110 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Casp8O89110 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Casp8O89110 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Casp8O89110 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Casp8O89110 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Casp8O89110 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Casp8O89110 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Casp8O89110 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Casp8O89110 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Casp8O89110 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Casp8O89110 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Casp8O89110 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Casp8O89110 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Casp8O89110 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Casp8O89110 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Casp8O89110 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Casp8O89110 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Casp8O89110 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Casp8O89110 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Casp8O89110 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Casp8O89110 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Casp8O89110 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Casp8O89110 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Casp8O89110 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Casp8O89110 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Casp8O89110 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Casp8O89110 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Casp8O89110 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Casp8O89110 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Casp8O89110 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Casp8O89110 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Casp8O89110 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Casp8O89110 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Casp8O89110 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Casp8O89110 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Casp8O89110 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Casp8O89110 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Casp8O89110 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Casp8O89110 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Casp8O89110 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Casp8O89110 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Casp8O89110 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Casp8O89110 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Casp8O89110 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Casp8O89110 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Casp8O89110 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms