Protein–RNA interactions for Protein: O89032

Sh3pxd2a, SH3 and PX domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 1,124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3pxd2aO89032 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh3pxd2aO89032 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh3pxd2aO89032 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh3pxd2aO89032 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh3pxd2aO89032 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh3pxd2aO89032 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh3pxd2aO89032 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh3pxd2aO89032 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh3pxd2aO89032 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh3pxd2aO89032 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh3pxd2aO89032 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh3pxd2aO89032 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh3pxd2aO89032 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh3pxd2aO89032 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh3pxd2aO89032 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh3pxd2aO89032 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh3pxd2aO89032 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh3pxd2aO89032 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh3pxd2aO89032 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh3pxd2aO89032 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh3pxd2aO89032 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh3pxd2aO89032 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh3pxd2aO89032 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh3pxd2aO89032 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh3pxd2aO89032 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh3pxd2aO89032 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh3pxd2aO89032 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh3pxd2aO89032 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh3pxd2aO89032 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh3pxd2aO89032 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh3pxd2aO89032 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh3pxd2aO89032 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh3pxd2aO89032 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh3pxd2aO89032 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh3pxd2aO89032 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh3pxd2aO89032 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh3pxd2aO89032 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh3pxd2aO89032 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh3pxd2aO89032 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh3pxd2aO89032 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh3pxd2aO89032 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh3pxd2aO89032 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh3pxd2aO89032 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh3pxd2aO89032 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh3pxd2aO89032 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh3pxd2aO89032 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh3pxd2aO89032 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh3pxd2aO89032 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh3pxd2aO89032 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh3pxd2aO89032 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh3pxd2aO89032 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh3pxd2aO89032 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh3pxd2aO89032 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh3pxd2aO89032 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh3pxd2aO89032 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh3pxd2aO89032 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh3pxd2aO89032 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh3pxd2aO89032 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh3pxd2aO89032 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh3pxd2aO89032 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh3pxd2aO89032 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh3pxd2aO89032 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh3pxd2aO89032 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh3pxd2aO89032 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh3pxd2aO89032 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh3pxd2aO89032 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh3pxd2aO89032 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sh3pxd2aO89032 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sh3pxd2aO89032 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sh3pxd2aO89032 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sh3pxd2aO89032 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sh3pxd2aO89032 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sh3pxd2aO89032 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sh3pxd2aO89032 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh3pxd2aO89032 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh3pxd2aO89032 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh3pxd2aO89032 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh3pxd2aO89032 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh3pxd2aO89032 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh3pxd2aO89032 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh3pxd2aO89032 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh3pxd2aO89032 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh3pxd2aO89032 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh3pxd2aO89032 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh3pxd2aO89032 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh3pxd2aO89032 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh3pxd2aO89032 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh3pxd2aO89032 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh3pxd2aO89032 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh3pxd2aO89032 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh3pxd2aO89032 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh3pxd2aO89032 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh3pxd2aO89032 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sh3pxd2aO89032 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sh3pxd2aO89032 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sh3pxd2aO89032 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sh3pxd2aO89032 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sh3pxd2aO89032 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sh3pxd2aO89032 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sh3pxd2aO89032 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms