Protein–RNA interactions for Protein: O88398

Avil, Advillin, mousemouse

Predictions only

Length 819 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AvilO88398 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AvilO88398 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AvilO88398 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AvilO88398 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AvilO88398 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AvilO88398 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AvilO88398 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AvilO88398 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AvilO88398 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AvilO88398 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AvilO88398 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AvilO88398 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AvilO88398 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AvilO88398 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AvilO88398 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AvilO88398 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AvilO88398 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AvilO88398 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AvilO88398 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AvilO88398 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AvilO88398 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AvilO88398 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AvilO88398 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AvilO88398 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AvilO88398 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AvilO88398 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AvilO88398 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
AvilO88398 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
AvilO88398 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AvilO88398 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AvilO88398 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AvilO88398 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AvilO88398 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AvilO88398 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AvilO88398 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AvilO88398 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AvilO88398 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AvilO88398 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AvilO88398 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AvilO88398 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AvilO88398 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AvilO88398 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AvilO88398 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AvilO88398 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AvilO88398 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AvilO88398 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AvilO88398 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AvilO88398 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AvilO88398 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AvilO88398 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AvilO88398 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AvilO88398 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AvilO88398 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AvilO88398 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AvilO88398 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AvilO88398 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AvilO88398 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AvilO88398 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AvilO88398 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AvilO88398 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AvilO88398 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AvilO88398 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AvilO88398 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AvilO88398 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AvilO88398 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AvilO88398 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AvilO88398 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AvilO88398 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AvilO88398 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AvilO88398 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AvilO88398 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AvilO88398 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AvilO88398 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AvilO88398 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AvilO88398 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
AvilO88398 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AvilO88398 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
AvilO88398 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AvilO88398 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AvilO88398 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AvilO88398 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AvilO88398 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AvilO88398 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AvilO88398 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AvilO88398 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AvilO88398 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AvilO88398 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AvilO88398 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AvilO88398 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AvilO88398 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AvilO88398 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AvilO88398 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AvilO88398 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AvilO88398 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AvilO88398 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AvilO88398 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AvilO88398 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AvilO88398 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AvilO88398 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
AvilO88398 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms