Protein–RNA interactions for Protein: O55127

Cyp26a1, Cytochrome P450 26A1, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp26a1O55127 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cyp26a1O55127 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cyp26a1O55127 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Cyp26a1O55127 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cyp26a1O55127 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cyp26a1O55127 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cyp26a1O55127 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cyp26a1O55127 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cyp26a1O55127 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cyp26a1O55127 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cyp26a1O55127 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cyp26a1O55127 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Cyp26a1O55127 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cyp26a1O55127 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cyp26a1O55127 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cyp26a1O55127 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cyp26a1O55127 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cyp26a1O55127 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cyp26a1O55127 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cyp26a1O55127 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cyp26a1O55127 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cyp26a1O55127 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cyp26a1O55127 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cyp26a1O55127 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cyp26a1O55127 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cyp26a1O55127 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cyp26a1O55127 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cyp26a1O55127 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cyp26a1O55127 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cyp26a1O55127 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cyp26a1O55127 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cyp26a1O55127 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cyp26a1O55127 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cyp26a1O55127 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cyp26a1O55127 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cyp26a1O55127 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cyp26a1O55127 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cyp26a1O55127 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cyp26a1O55127 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cyp26a1O55127 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cyp26a1O55127 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cyp26a1O55127 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cyp26a1O55127 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cyp26a1O55127 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cyp26a1O55127 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cyp26a1O55127 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cyp26a1O55127 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Cyp26a1O55127 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cyp26a1O55127 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cyp26a1O55127 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cyp26a1O55127 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cyp26a1O55127 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cyp26a1O55127 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cyp26a1O55127 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cyp26a1O55127 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cyp26a1O55127 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cyp26a1O55127 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cyp26a1O55127 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cyp26a1O55127 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cyp26a1O55127 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cyp26a1O55127 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Cyp26a1O55127 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Cyp26a1O55127 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cyp26a1O55127 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cyp26a1O55127 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Cyp26a1O55127 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cyp26a1O55127 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cyp26a1O55127 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cyp26a1O55127 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cyp26a1O55127 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cyp26a1O55127 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cyp26a1O55127 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cyp26a1O55127 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cyp26a1O55127 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Cyp26a1O55127 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cyp26a1O55127 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cyp26a1O55127 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cyp26a1O55127 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cyp26a1O55127 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cyp26a1O55127 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cyp26a1O55127 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cyp26a1O55127 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cyp26a1O55127 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cyp26a1O55127 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cyp26a1O55127 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cyp26a1O55127 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cyp26a1O55127 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cyp26a1O55127 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cyp26a1O55127 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cyp26a1O55127 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cyp26a1O55127 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cyp26a1O55127 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cyp26a1O55127 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cyp26a1O55127 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cyp26a1O55127 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cyp26a1O55127 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cyp26a1O55127 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cyp26a1O55127 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cyp26a1O55127 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cyp26a1O55127 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms