Protein–RNA interactions for Protein: O55082

Ptpn20, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 20, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn20O55082 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ptpn20O55082 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ptpn20O55082 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ptpn20O55082 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ptpn20O55082 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ptpn20O55082 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ptpn20O55082 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ptpn20O55082 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ptpn20O55082 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ptpn20O55082 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ptpn20O55082 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ptpn20O55082 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ptpn20O55082 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ptpn20O55082 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ptpn20O55082 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ptpn20O55082 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ptpn20O55082 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ptpn20O55082 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ptpn20O55082 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ptpn20O55082 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ptpn20O55082 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ptpn20O55082 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ptpn20O55082 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ptpn20O55082 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ptpn20O55082 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ptpn20O55082 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ptpn20O55082 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ptpn20O55082 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ptpn20O55082 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ptpn20O55082 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ptpn20O55082 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptpn20O55082 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptpn20O55082 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptpn20O55082 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptpn20O55082 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptpn20O55082 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptpn20O55082 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptpn20O55082 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptpn20O55082 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptpn20O55082 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptpn20O55082 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptpn20O55082 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptpn20O55082 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptpn20O55082 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptpn20O55082 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptpn20O55082 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptpn20O55082 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptpn20O55082 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Ptpn20O55082 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Ptpn20O55082 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptpn20O55082 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptpn20O55082 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptpn20O55082 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptpn20O55082 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptpn20O55082 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptpn20O55082 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptpn20O55082 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptpn20O55082 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptpn20O55082 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptpn20O55082 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptpn20O55082 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptpn20O55082 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptpn20O55082 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptpn20O55082 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptpn20O55082 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptpn20O55082 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptpn20O55082 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptpn20O55082 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptpn20O55082 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptpn20O55082 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptpn20O55082 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptpn20O55082 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptpn20O55082 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptpn20O55082 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptpn20O55082 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptpn20O55082 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptpn20O55082 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptpn20O55082 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptpn20O55082 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptpn20O55082 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptpn20O55082 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptpn20O55082 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptpn20O55082 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptpn20O55082 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptpn20O55082 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptpn20O55082 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptpn20O55082 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptpn20O55082 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptpn20O55082 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptpn20O55082 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptpn20O55082 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptpn20O55082 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptpn20O55082 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptpn20O55082 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptpn20O55082 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptpn20O55082 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptpn20O55082 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptpn20O55082 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptpn20O55082 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptpn20O55082 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms