Protein–RNA interactions for Protein: O54988

Slk, STE20-like serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlkO54988 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SlkO54988 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SlkO54988 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SlkO54988 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SlkO54988 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SlkO54988 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SlkO54988 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SlkO54988 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SlkO54988 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SlkO54988 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SlkO54988 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SlkO54988 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SlkO54988 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SlkO54988 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SlkO54988 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SlkO54988 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SlkO54988 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SlkO54988 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SlkO54988 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SlkO54988 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SlkO54988 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SlkO54988 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SlkO54988 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SlkO54988 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SlkO54988 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SlkO54988 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SlkO54988 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SlkO54988 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SlkO54988 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SlkO54988 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SlkO54988 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SlkO54988 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SlkO54988 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SlkO54988 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SlkO54988 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SlkO54988 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SlkO54988 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SlkO54988 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SlkO54988 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SlkO54988 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SlkO54988 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SlkO54988 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SlkO54988 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SlkO54988 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SlkO54988 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SlkO54988 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SlkO54988 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SlkO54988 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SlkO54988 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SlkO54988 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SlkO54988 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SlkO54988 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SlkO54988 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SlkO54988 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SlkO54988 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SlkO54988 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SlkO54988 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SlkO54988 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SlkO54988 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SlkO54988 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SlkO54988 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SlkO54988 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SlkO54988 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SlkO54988 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SlkO54988 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SlkO54988 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SlkO54988 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SlkO54988 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SlkO54988 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SlkO54988 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SlkO54988 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SlkO54988 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SlkO54988 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SlkO54988 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SlkO54988 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SlkO54988 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SlkO54988 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SlkO54988 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SlkO54988 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SlkO54988 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SlkO54988 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SlkO54988 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SlkO54988 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SlkO54988 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SlkO54988 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SlkO54988 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SlkO54988 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SlkO54988 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SlkO54988 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SlkO54988 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SlkO54988 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SlkO54988 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SlkO54988 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SlkO54988 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SlkO54988 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SlkO54988 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SlkO54988 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SlkO54988 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SlkO54988 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SlkO54988 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms