Protein–RNA interactions for Protein: O54951

Sema6b, Semaphorin-6B, mousemouse

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6bO54951 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sema6bO54951 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sema6bO54951 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sema6bO54951 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sema6bO54951 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sema6bO54951 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sema6bO54951 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Sema6bO54951 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sema6bO54951 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sema6bO54951 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sema6bO54951 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sema6bO54951 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sema6bO54951 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sema6bO54951 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sema6bO54951 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Sema6bO54951 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sema6bO54951 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sema6bO54951 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sema6bO54951 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sema6bO54951 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
Sema6bO54951 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Sema6bO54951 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Sema6bO54951 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Sema6bO54951 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
Sema6bO54951 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Sema6bO54951 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Sema6bO54951 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sema6bO54951 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sema6bO54951 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Sema6bO54951 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sema6bO54951 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Sema6bO54951 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sema6bO54951 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sema6bO54951 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sema6bO54951 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sema6bO54951 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sema6bO54951 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sema6bO54951 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Sema6bO54951 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sema6bO54951 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sema6bO54951 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sema6bO54951 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Sema6bO54951 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sema6bO54951 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sema6bO54951 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sema6bO54951 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sema6bO54951 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sema6bO54951 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sema6bO54951 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sema6bO54951 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sema6bO54951 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sema6bO54951 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sema6bO54951 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sema6bO54951 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sema6bO54951 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sema6bO54951 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sema6bO54951 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sema6bO54951 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sema6bO54951 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sema6bO54951 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sema6bO54951 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sema6bO54951 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sema6bO54951 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sema6bO54951 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sema6bO54951 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sema6bO54951 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sema6bO54951 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sema6bO54951 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sema6bO54951 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Sema6bO54951 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sema6bO54951 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sema6bO54951 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sema6bO54951 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Sema6bO54951 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sema6bO54951 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sema6bO54951 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Sema6bO54951 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Sema6bO54951 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Sema6bO54951 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Sema6bO54951 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sema6bO54951 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sema6bO54951 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sema6bO54951 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sema6bO54951 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sema6bO54951 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sema6bO54951 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sema6bO54951 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sema6bO54951 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sema6bO54951 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sema6bO54951 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sema6bO54951 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sema6bO54951 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sema6bO54951 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Sema6bO54951 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sema6bO54951 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sema6bO54951 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sema6bO54951 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sema6bO54951 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sema6bO54951 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sema6bO54951 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms