Protein–RNA interactions for Protein: O54799

Nmbr, Neuromedin-B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NmbrO54799 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NmbrO54799 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NmbrO54799 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NmbrO54799 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NmbrO54799 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NmbrO54799 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NmbrO54799 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NmbrO54799 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NmbrO54799 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NmbrO54799 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NmbrO54799 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NmbrO54799 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NmbrO54799 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NmbrO54799 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NmbrO54799 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NmbrO54799 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NmbrO54799 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NmbrO54799 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NmbrO54799 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NmbrO54799 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NmbrO54799 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NmbrO54799 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NmbrO54799 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NmbrO54799 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NmbrO54799 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NmbrO54799 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NmbrO54799 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NmbrO54799 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NmbrO54799 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NmbrO54799 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NmbrO54799 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NmbrO54799 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NmbrO54799 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NmbrO54799 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NmbrO54799 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NmbrO54799 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NmbrO54799 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NmbrO54799 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NmbrO54799 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NmbrO54799 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NmbrO54799 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NmbrO54799 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
NmbrO54799 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NmbrO54799 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NmbrO54799 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NmbrO54799 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NmbrO54799 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NmbrO54799 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NmbrO54799 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NmbrO54799 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NmbrO54799 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NmbrO54799 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NmbrO54799 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NmbrO54799 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NmbrO54799 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NmbrO54799 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NmbrO54799 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NmbrO54799 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NmbrO54799 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NmbrO54799 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NmbrO54799 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NmbrO54799 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NmbrO54799 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NmbrO54799 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NmbrO54799 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NmbrO54799 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NmbrO54799 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NmbrO54799 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NmbrO54799 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NmbrO54799 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NmbrO54799 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NmbrO54799 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NmbrO54799 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NmbrO54799 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NmbrO54799 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NmbrO54799 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NmbrO54799 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NmbrO54799 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NmbrO54799 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NmbrO54799 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NmbrO54799 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NmbrO54799 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NmbrO54799 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NmbrO54799 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NmbrO54799 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NmbrO54799 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NmbrO54799 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NmbrO54799 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NmbrO54799 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NmbrO54799 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NmbrO54799 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NmbrO54799 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NmbrO54799 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NmbrO54799 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NmbrO54799 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NmbrO54799 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NmbrO54799 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NmbrO54799 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NmbrO54799 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NmbrO54799 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms