Protein–RNA interactions for Protein: O35943

Fxn, Frataxin, mitochondrial, mousemouse

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FxnO35943 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FxnO35943 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FxnO35943 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FxnO35943 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FxnO35943 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FxnO35943 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FxnO35943 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FxnO35943 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FxnO35943 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FxnO35943 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
FxnO35943 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FxnO35943 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FxnO35943 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FxnO35943 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FxnO35943 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
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FxnO35943 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FxnO35943 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FxnO35943 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FxnO35943 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FxnO35943 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FxnO35943 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FxnO35943 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FxnO35943 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FxnO35943 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FxnO35943 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FxnO35943 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FxnO35943 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FxnO35943 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FxnO35943 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FxnO35943 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FxnO35943 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FxnO35943 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FxnO35943 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FxnO35943 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FxnO35943 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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FxnO35943 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FxnO35943 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FxnO35943 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FxnO35943 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FxnO35943 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FxnO35943 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
FxnO35943 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FxnO35943 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FxnO35943 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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FxnO35943 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FxnO35943 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FxnO35943 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FxnO35943 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FxnO35943 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FxnO35943 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FxnO35943 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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FxnO35943 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FxnO35943 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FxnO35943 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FxnO35943 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FxnO35943 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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FxnO35943 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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FxnO35943 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
FxnO35943 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
FxnO35943 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
FxnO35943 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
FxnO35943 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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FxnO35943 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FxnO35943 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
FxnO35943 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FxnO35943 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FxnO35943 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FxnO35943 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FxnO35943 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FxnO35943 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FxnO35943 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
FxnO35943 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FxnO35943 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FxnO35943 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FxnO35943 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
FxnO35943 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FxnO35943 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FxnO35943 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FxnO35943 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FxnO35943 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms