Protein–RNA interactions for Protein: O35914

Bnc1, Zinc finger protein basonuclin-1, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bnc1O35914 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bnc1O35914 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bnc1O35914 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bnc1O35914 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bnc1O35914 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bnc1O35914 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bnc1O35914 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bnc1O35914 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bnc1O35914 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bnc1O35914 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bnc1O35914 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bnc1O35914 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bnc1O35914 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Bnc1O35914 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bnc1O35914 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bnc1O35914 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bnc1O35914 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bnc1O35914 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bnc1O35914 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bnc1O35914 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bnc1O35914 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bnc1O35914 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bnc1O35914 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bnc1O35914 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bnc1O35914 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bnc1O35914 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bnc1O35914 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bnc1O35914 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bnc1O35914 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bnc1O35914 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bnc1O35914 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bnc1O35914 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bnc1O35914 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bnc1O35914 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bnc1O35914 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Bnc1O35914 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bnc1O35914 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bnc1O35914 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bnc1O35914 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bnc1O35914 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bnc1O35914 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bnc1O35914 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bnc1O35914 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bnc1O35914 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bnc1O35914 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bnc1O35914 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bnc1O35914 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bnc1O35914 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bnc1O35914 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bnc1O35914 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bnc1O35914 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bnc1O35914 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bnc1O35914 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bnc1O35914 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bnc1O35914 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bnc1O35914 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bnc1O35914 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bnc1O35914 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bnc1O35914 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bnc1O35914 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bnc1O35914 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bnc1O35914 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bnc1O35914 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bnc1O35914 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Bnc1O35914 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Bnc1O35914 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Bnc1O35914 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bnc1O35914 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bnc1O35914 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bnc1O35914 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bnc1O35914 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bnc1O35914 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bnc1O35914 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bnc1O35914 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bnc1O35914 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bnc1O35914 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bnc1O35914 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bnc1O35914 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bnc1O35914 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bnc1O35914 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bnc1O35914 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bnc1O35914 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bnc1O35914 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bnc1O35914 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bnc1O35914 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bnc1O35914 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bnc1O35914 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bnc1O35914 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bnc1O35914 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bnc1O35914 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bnc1O35914 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bnc1O35914 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bnc1O35914 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bnc1O35914 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bnc1O35914 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bnc1O35914 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bnc1O35914 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bnc1O35914 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Bnc1O35914 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Bnc1O35914 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms