Protein–RNA interactions for Protein: O35690

Phox2b, Paired mesoderm homeobox protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phox2bO35690 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phox2bO35690 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phox2bO35690 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phox2bO35690 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phox2bO35690 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phox2bO35690 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phox2bO35690 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phox2bO35690 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Phox2bO35690 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Phox2bO35690 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Phox2bO35690 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Phox2bO35690 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Phox2bO35690 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Phox2bO35690 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Phox2bO35690 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Phox2bO35690 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Phox2bO35690 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Phox2bO35690 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Phox2bO35690 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Phox2bO35690 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Phox2bO35690 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Phox2bO35690 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Phox2bO35690 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Phox2bO35690 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Phox2bO35690 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Phox2bO35690 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Phox2bO35690 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Phox2bO35690 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Phox2bO35690 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Phox2bO35690 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Phox2bO35690 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Phox2bO35690 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Phox2bO35690 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Phox2bO35690 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Phox2bO35690 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Phox2bO35690 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Phox2bO35690 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Phox2bO35690 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Phox2bO35690 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Phox2bO35690 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Phox2bO35690 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Phox2bO35690 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Phox2bO35690 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Phox2bO35690 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Phox2bO35690 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Phox2bO35690 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Phox2bO35690 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Phox2bO35690 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Phox2bO35690 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Phox2bO35690 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Phox2bO35690 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Phox2bO35690 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Phox2bO35690 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Phox2bO35690 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Phox2bO35690 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Phox2bO35690 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Phox2bO35690 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Phox2bO35690 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Phox2bO35690 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Phox2bO35690 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Phox2bO35690 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Phox2bO35690 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Phox2bO35690 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Phox2bO35690 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Phox2bO35690 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Phox2bO35690 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Phox2bO35690 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Phox2bO35690 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Phox2bO35690 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Phox2bO35690 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Phox2bO35690 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Phox2bO35690 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phox2bO35690 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phox2bO35690 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phox2bO35690 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phox2bO35690 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phox2bO35690 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phox2bO35690 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phox2bO35690 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phox2bO35690 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phox2bO35690 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phox2bO35690 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phox2bO35690 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phox2bO35690 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phox2bO35690 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phox2bO35690 G530012D18Rik-201ENSMUST00000178024 420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phox2bO35690 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phox2bO35690 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phox2bO35690 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phox2bO35690 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phox2bO35690 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phox2bO35690 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phox2bO35690 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phox2bO35690 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phox2bO35690 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Phox2bO35690 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Phox2bO35690 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Phox2bO35690 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Phox2bO35690 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Phox2bO35690 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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