Protein–RNA interactions for Protein: O35638

Stag2, Cohesin subunit SA-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stag2O35638 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stag2O35638 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stag2O35638 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stag2O35638 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Stag2O35638 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Stag2O35638 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stag2O35638 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stag2O35638 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Stag2O35638 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Stag2O35638 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stag2O35638 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stag2O35638 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stag2O35638 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Stag2O35638 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stag2O35638 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stag2O35638 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stag2O35638 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stag2O35638 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stag2O35638 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stag2O35638 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stag2O35638 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stag2O35638 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stag2O35638 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stag2O35638 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stag2O35638 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stag2O35638 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stag2O35638 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stag2O35638 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stag2O35638 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stag2O35638 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stag2O35638 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stag2O35638 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stag2O35638 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stag2O35638 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stag2O35638 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stag2O35638 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Stag2O35638 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stag2O35638 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stag2O35638 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stag2O35638 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stag2O35638 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stag2O35638 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stag2O35638 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stag2O35638 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stag2O35638 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stag2O35638 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stag2O35638 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stag2O35638 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stag2O35638 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stag2O35638 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stag2O35638 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stag2O35638 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stag2O35638 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stag2O35638 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stag2O35638 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stag2O35638 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stag2O35638 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stag2O35638 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stag2O35638 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stag2O35638 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stag2O35638 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stag2O35638 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stag2O35638 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stag2O35638 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stag2O35638 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stag2O35638 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stag2O35638 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stag2O35638 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stag2O35638 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stag2O35638 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stag2O35638 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stag2O35638 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stag2O35638 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Stag2O35638 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Stag2O35638 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Stag2O35638 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Stag2O35638 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Stag2O35638 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Stag2O35638 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Stag2O35638 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Stag2O35638 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Stag2O35638 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Stag2O35638 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Stag2O35638 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Stag2O35638 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Stag2O35638 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Stag2O35638 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Stag2O35638 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Stag2O35638 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Stag2O35638 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Stag2O35638 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Stag2O35638 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Stag2O35638 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Stag2O35638 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Stag2O35638 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stag2O35638 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stag2O35638 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stag2O35638 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stag2O35638 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stag2O35638 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms