Protein–RNA interactions for Protein: O35491

Clk2, Dual specificity protein kinase CLK2, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk2O35491 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clk2O35491 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clk2O35491 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clk2O35491 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clk2O35491 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clk2O35491 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clk2O35491 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clk2O35491 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clk2O35491 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clk2O35491 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clk2O35491 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clk2O35491 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clk2O35491 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clk2O35491 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clk2O35491 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clk2O35491 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clk2O35491 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clk2O35491 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clk2O35491 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clk2O35491 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clk2O35491 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clk2O35491 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clk2O35491 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clk2O35491 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clk2O35491 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clk2O35491 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clk2O35491 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Clk2O35491 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Clk2O35491 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clk2O35491 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clk2O35491 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clk2O35491 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clk2O35491 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clk2O35491 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Clk2O35491 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clk2O35491 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clk2O35491 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clk2O35491 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clk2O35491 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clk2O35491 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clk2O35491 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clk2O35491 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clk2O35491 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clk2O35491 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clk2O35491 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clk2O35491 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clk2O35491 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clk2O35491 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clk2O35491 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clk2O35491 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Clk2O35491 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Clk2O35491 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clk2O35491 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clk2O35491 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clk2O35491 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clk2O35491 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clk2O35491 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clk2O35491 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clk2O35491 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clk2O35491 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clk2O35491 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clk2O35491 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clk2O35491 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clk2O35491 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clk2O35491 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clk2O35491 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clk2O35491 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clk2O35491 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clk2O35491 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clk2O35491 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clk2O35491 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clk2O35491 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clk2O35491 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clk2O35491 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clk2O35491 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clk2O35491 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clk2O35491 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clk2O35491 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clk2O35491 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clk2O35491 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clk2O35491 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clk2O35491 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clk2O35491 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clk2O35491 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clk2O35491 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clk2O35491 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clk2O35491 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clk2O35491 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clk2O35491 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clk2O35491 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clk2O35491 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clk2O35491 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clk2O35491 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Clk2O35491 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Clk2O35491 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clk2O35491 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clk2O35491 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clk2O35491 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clk2O35491 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clk2O35491 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.5 ms