Protein–RNA interactions for Protein: O35345

Kpna6, Importin subunit alpha-7, mousemouse

Predictions only

Length 536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna6O35345 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kpna6O35345 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kpna6O35345 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kpna6O35345 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kpna6O35345 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kpna6O35345 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kpna6O35345 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kpna6O35345 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kpna6O35345 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kpna6O35345 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kpna6O35345 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kpna6O35345 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kpna6O35345 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kpna6O35345 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kpna6O35345 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kpna6O35345 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kpna6O35345 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Kpna6O35345 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kpna6O35345 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kpna6O35345 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kpna6O35345 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Kpna6O35345 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Kpna6O35345 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Kpna6O35345 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Kpna6O35345 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Kpna6O35345 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Kpna6O35345 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Kpna6O35345 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Kpna6O35345 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Kpna6O35345 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Kpna6O35345 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Kpna6O35345 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Kpna6O35345 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Kpna6O35345 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Kpna6O35345 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Kpna6O35345 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Kpna6O35345 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Kpna6O35345 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Kpna6O35345 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Kpna6O35345 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Kpna6O35345 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Kpna6O35345 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Kpna6O35345 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Kpna6O35345 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Kpna6O35345 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kpna6O35345 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kpna6O35345 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kpna6O35345 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kpna6O35345 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kpna6O35345 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kpna6O35345 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kpna6O35345 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kpna6O35345 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kpna6O35345 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kpna6O35345 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kpna6O35345 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kpna6O35345 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kpna6O35345 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Kpna6O35345 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kpna6O35345 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kpna6O35345 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kpna6O35345 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kpna6O35345 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kpna6O35345 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kpna6O35345 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kpna6O35345 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kpna6O35345 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kpna6O35345 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kpna6O35345 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kpna6O35345 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kpna6O35345 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kpna6O35345 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Kpna6O35345 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kpna6O35345 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kpna6O35345 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kpna6O35345 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Kpna6O35345 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kpna6O35345 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kpna6O35345 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kpna6O35345 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kpna6O35345 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kpna6O35345 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kpna6O35345 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kpna6O35345 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Kpna6O35345 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Kpna6O35345 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Kpna6O35345 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Kpna6O35345 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Kpna6O35345 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Kpna6O35345 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Kpna6O35345 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Kpna6O35345 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Kpna6O35345 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Kpna6O35345 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Kpna6O35345 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Kpna6O35345 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Kpna6O35345 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Kpna6O35345 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Kpna6O35345 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Kpna6O35345 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms