Protein–RNA interactions for Protein: O35134

Polr1a, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1aO35134 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Polr1aO35134 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Polr1aO35134 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Polr1aO35134 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Polr1aO35134 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Polr1aO35134 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Polr1aO35134 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Polr1aO35134 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Polr1aO35134 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Polr1aO35134 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Polr1aO35134 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Polr1aO35134 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Polr1aO35134 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Polr1aO35134 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Polr1aO35134 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Polr1aO35134 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Polr1aO35134 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Polr1aO35134 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Polr1aO35134 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Polr1aO35134 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Polr1aO35134 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Polr1aO35134 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Polr1aO35134 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Polr1aO35134 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Polr1aO35134 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Polr1aO35134 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Polr1aO35134 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Polr1aO35134 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Polr1aO35134 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Polr1aO35134 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Polr1aO35134 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Polr1aO35134 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Polr1aO35134 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Polr1aO35134 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Polr1aO35134 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Polr1aO35134 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Polr1aO35134 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Polr1aO35134 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Polr1aO35134 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Polr1aO35134 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Polr1aO35134 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Polr1aO35134 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Polr1aO35134 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Polr1aO35134 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Polr1aO35134 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Polr1aO35134 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Polr1aO35134 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Polr1aO35134 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Polr1aO35134 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Polr1aO35134 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Polr1aO35134 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Polr1aO35134 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Polr1aO35134 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Polr1aO35134 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Polr1aO35134 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Polr1aO35134 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Polr1aO35134 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Polr1aO35134 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Polr1aO35134 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Polr1aO35134 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Polr1aO35134 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Polr1aO35134 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Polr1aO35134 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Polr1aO35134 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Polr1aO35134 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Polr1aO35134 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Polr1aO35134 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Polr1aO35134 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Polr1aO35134 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Polr1aO35134 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Polr1aO35134 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Polr1aO35134 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Polr1aO35134 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Polr1aO35134 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Polr1aO35134 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Polr1aO35134 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Polr1aO35134 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Polr1aO35134 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Polr1aO35134 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Polr1aO35134 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Polr1aO35134 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Polr1aO35134 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Polr1aO35134 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Polr1aO35134 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Polr1aO35134 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Polr1aO35134 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Polr1aO35134 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Polr1aO35134 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Polr1aO35134 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Polr1aO35134 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Polr1aO35134 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Polr1aO35134 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Polr1aO35134 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Polr1aO35134 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Polr1aO35134 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Polr1aO35134 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Polr1aO35134 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Polr1aO35134 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Polr1aO35134 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Polr1aO35134 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms