Protein–RNA interactions for Protein: O35054

Cldn4, Claudin-4, mousemouse

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn4O35054 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn4O35054 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn4O35054 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn4O35054 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn4O35054 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn4O35054 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn4O35054 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn4O35054 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn4O35054 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn4O35054 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn4O35054 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn4O35054 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn4O35054 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn4O35054 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn4O35054 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn4O35054 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn4O35054 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn4O35054 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn4O35054 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn4O35054 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn4O35054 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn4O35054 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn4O35054 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn4O35054 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn4O35054 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn4O35054 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn4O35054 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn4O35054 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn4O35054 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn4O35054 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn4O35054 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn4O35054 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn4O35054 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn4O35054 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn4O35054 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn4O35054 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn4O35054 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn4O35054 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn4O35054 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn4O35054 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn4O35054 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn4O35054 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn4O35054 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn4O35054 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn4O35054 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn4O35054 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn4O35054 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn4O35054 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn4O35054 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn4O35054 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn4O35054 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn4O35054 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn4O35054 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn4O35054 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn4O35054 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn4O35054 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn4O35054 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn4O35054 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn4O35054 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn4O35054 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn4O35054 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn4O35054 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
Cldn4O35054 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn4O35054 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn4O35054 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn4O35054 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn4O35054 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn4O35054 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn4O35054 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn4O35054 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn4O35054 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn4O35054 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn4O35054 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn4O35054 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn4O35054 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn4O35054 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn4O35054 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn4O35054 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn4O35054 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn4O35054 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn4O35054 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn4O35054 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn4O35054 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn4O35054 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn4O35054 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn4O35054 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn4O35054 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn4O35054 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn4O35054 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn4O35054 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn4O35054 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn4O35054 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn4O35054 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn4O35054 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn4O35054 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn4O35054 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn4O35054 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn4O35054 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn4O35054 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn4O35054 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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