Protein–RNA interactions for Protein: O19441

H2-Q1, Histocompatibility 2, Q region locus 1, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q1O19441 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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H2-Q1O19441 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-Q1O19441 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-Q1O19441 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-Q1O19441 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-Q1O19441 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-Q1O19441 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-Q1O19441 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-Q1O19441 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-Q1O19441 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-Q1O19441 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-Q1O19441 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-Q1O19441 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-Q1O19441 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-Q1O19441 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-Q1O19441 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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H2-Q1O19441 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-Q1O19441 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-Q1O19441 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-Q1O19441 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-Q1O19441 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-Q1O19441 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-Q1O19441 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-Q1O19441 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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H2-Q1O19441 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-Q1O19441 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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H2-Q1O19441 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-Q1O19441 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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H2-Q1O19441 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-Q1O19441 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-Q1O19441 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-Q1O19441 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-Q1O19441 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-Q1O19441 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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H2-Q1O19441 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-Q1O19441 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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H2-Q1O19441 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-Q1O19441 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-Q1O19441 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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H2-Q1O19441 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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H2-Q1O19441 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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H2-Q1O19441 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
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H2-Q1O19441 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-Q1O19441 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-Q1O19441 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-Q1O19441 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-Q1O19441 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-Q1O19441 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-Q1O19441 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-Q1O19441 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-Q1O19441 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-Q1O19441 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-Q1O19441 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-Q1O19441 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-Q1O19441 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-Q1O19441 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-Q1O19441 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-Q1O19441 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-Q1O19441 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-Q1O19441 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-Q1O19441 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-Q1O19441 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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