Protein–RNA interactions for Protein: O08786

Cckar, Cholecystokinin receptor type A, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CckarO08786 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CckarO08786 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CckarO08786 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CckarO08786 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CckarO08786 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CckarO08786 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CckarO08786 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CckarO08786 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CckarO08786 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CckarO08786 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CckarO08786 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CckarO08786 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CckarO08786 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CckarO08786 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CckarO08786 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CckarO08786 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CckarO08786 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CckarO08786 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CckarO08786 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CckarO08786 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CckarO08786 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CckarO08786 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CckarO08786 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CckarO08786 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CckarO08786 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CckarO08786 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CckarO08786 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CckarO08786 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CckarO08786 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CckarO08786 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CckarO08786 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CckarO08786 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CckarO08786 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CckarO08786 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CckarO08786 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CckarO08786 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CckarO08786 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CckarO08786 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CckarO08786 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CckarO08786 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CckarO08786 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CckarO08786 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CckarO08786 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CckarO08786 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CckarO08786 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CckarO08786 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
CckarO08786 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CckarO08786 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CckarO08786 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CckarO08786 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CckarO08786 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CckarO08786 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CckarO08786 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CckarO08786 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CckarO08786 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CckarO08786 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CckarO08786 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CckarO08786 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CckarO08786 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CckarO08786 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CckarO08786 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CckarO08786 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
CckarO08786 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CckarO08786 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CckarO08786 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CckarO08786 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CckarO08786 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CckarO08786 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CckarO08786 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CckarO08786 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CckarO08786 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CckarO08786 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CckarO08786 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CckarO08786 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CckarO08786 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CckarO08786 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CckarO08786 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CckarO08786 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
CckarO08786 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CckarO08786 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CckarO08786 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CckarO08786 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CckarO08786 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CckarO08786 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CckarO08786 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CckarO08786 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CckarO08786 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CckarO08786 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CckarO08786 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CckarO08786 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CckarO08786 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CckarO08786 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CckarO08786 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CckarO08786 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CckarO08786 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CckarO08786 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CckarO08786 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CckarO08786 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CckarO08786 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CckarO08786 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms