Protein–RNA interactions for Protein: L7N2D9

Gm3239, Predicted gene 3239, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3239L7N2D9 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Gm3239L7N2D9 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3239L7N2D9 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3239L7N2D9 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3239L7N2D9 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Gm3239L7N2D9 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3239L7N2D9 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3239L7N2D9 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3239L7N2D9 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3239L7N2D9 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3239L7N2D9 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Gm3239L7N2D9 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3239L7N2D9 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3239L7N2D9 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3239L7N2D9 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Gm3239L7N2D9 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3239L7N2D9 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Gm3239L7N2D9 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Gm3239L7N2D9 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3239L7N2D9 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3239L7N2D9 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3239L7N2D9 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3239L7N2D9 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Gm3239L7N2D9 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3239L7N2D9 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3239L7N2D9 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Gm3239L7N2D9 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3239L7N2D9 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Gm3239L7N2D9 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3239L7N2D9 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3239L7N2D9 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Gm3239L7N2D9 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3239L7N2D9 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3239L7N2D9 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Gm3239L7N2D9 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3239L7N2D9 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3239L7N2D9 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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