Protein–RNA interactions for Protein: J3QPE5

Gm5849, Predicted gene 5849, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5849J3QPE5 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm5849J3QPE5 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm5849J3QPE5 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm5849J3QPE5 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm5849J3QPE5 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm5849J3QPE5 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm5849J3QPE5 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm5849J3QPE5 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm5849J3QPE5 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm5849J3QPE5 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm5849J3QPE5 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm5849J3QPE5 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm5849J3QPE5 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm5849J3QPE5 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm5849J3QPE5 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm5849J3QPE5 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm5849J3QPE5 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm5849J3QPE5 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm5849J3QPE5 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm5849J3QPE5 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm5849J3QPE5 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm5849J3QPE5 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm5849J3QPE5 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm5849J3QPE5 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm5849J3QPE5 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm5849J3QPE5 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm5849J3QPE5 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm5849J3QPE5 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm5849J3QPE5 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm5849J3QPE5 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm5849J3QPE5 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm5849J3QPE5 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm5849J3QPE5 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm5849J3QPE5 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm5849J3QPE5 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm5849J3QPE5 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm5849J3QPE5 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm5849J3QPE5 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm5849J3QPE5 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm5849J3QPE5 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm5849J3QPE5 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm5849J3QPE5 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm5849J3QPE5 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm5849J3QPE5 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm5849J3QPE5 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm5849J3QPE5 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm5849J3QPE5 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm5849J3QPE5 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm5849J3QPE5 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm5849J3QPE5 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm5849J3QPE5 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm5849J3QPE5 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm5849J3QPE5 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm5849J3QPE5 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm5849J3QPE5 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm5849J3QPE5 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm5849J3QPE5 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm5849J3QPE5 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm5849J3QPE5 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm5849J3QPE5 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm5849J3QPE5 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm5849J3QPE5 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm5849J3QPE5 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm5849J3QPE5 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm5849J3QPE5 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm5849J3QPE5 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm5849J3QPE5 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm5849J3QPE5 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm5849J3QPE5 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm5849J3QPE5 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm5849J3QPE5 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm5849J3QPE5 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm5849J3QPE5 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm5849J3QPE5 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm5849J3QPE5 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm5849J3QPE5 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm5849J3QPE5 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm5849J3QPE5 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm5849J3QPE5 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm5849J3QPE5 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm5849J3QPE5 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm5849J3QPE5 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm5849J3QPE5 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm5849J3QPE5 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm5849J3QPE5 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm5849J3QPE5 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm5849J3QPE5 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm5849J3QPE5 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm5849J3QPE5 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm5849J3QPE5 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm5849J3QPE5 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm5849J3QPE5 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm5849J3QPE5 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm5849J3QPE5 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm5849J3QPE5 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm5849J3QPE5 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm5849J3QPE5 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm5849J3QPE5 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm5849J3QPE5 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm5849J3QPE5 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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