Protein–RNA interactions for Protein: J3QNG1

Gm6408, Predicted gene 6408, mousemouse

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Length 320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6408J3QNG1 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm6408J3QNG1 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm6408J3QNG1 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm6408J3QNG1 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm6408J3QNG1 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm6408J3QNG1 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm6408J3QNG1 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm6408J3QNG1 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm6408J3QNG1 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm6408J3QNG1 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm6408J3QNG1 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm6408J3QNG1 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm6408J3QNG1 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm6408J3QNG1 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm6408J3QNG1 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm6408J3QNG1 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm6408J3QNG1 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm6408J3QNG1 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm6408J3QNG1 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm6408J3QNG1 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm6408J3QNG1 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm6408J3QNG1 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm6408J3QNG1 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm6408J3QNG1 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm6408J3QNG1 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm6408J3QNG1 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm6408J3QNG1 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm6408J3QNG1 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm6408J3QNG1 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm6408J3QNG1 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm6408J3QNG1 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm6408J3QNG1 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm6408J3QNG1 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm6408J3QNG1 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm6408J3QNG1 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm6408J3QNG1 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm6408J3QNG1 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm6408J3QNG1 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm6408J3QNG1 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm6408J3QNG1 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm6408J3QNG1 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm6408J3QNG1 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm6408J3QNG1 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm6408J3QNG1 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm6408J3QNG1 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm6408J3QNG1 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm6408J3QNG1 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm6408J3QNG1 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm6408J3QNG1 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm6408J3QNG1 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm6408J3QNG1 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm6408J3QNG1 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm6408J3QNG1 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm6408J3QNG1 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm6408J3QNG1 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm6408J3QNG1 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm6408J3QNG1 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm6408J3QNG1 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm6408J3QNG1 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm6408J3QNG1 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm6408J3QNG1 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm6408J3QNG1 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm6408J3QNG1 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm6408J3QNG1 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm6408J3QNG1 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm6408J3QNG1 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm6408J3QNG1 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm6408J3QNG1 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm6408J3QNG1 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm6408J3QNG1 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm6408J3QNG1 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm6408J3QNG1 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm6408J3QNG1 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm6408J3QNG1 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm6408J3QNG1 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm6408J3QNG1 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm6408J3QNG1 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm6408J3QNG1 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm6408J3QNG1 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm6408J3QNG1 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm6408J3QNG1 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm6408J3QNG1 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm6408J3QNG1 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm6408J3QNG1 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm6408J3QNG1 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm6408J3QNG1 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm6408J3QNG1 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm6408J3QNG1 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm6408J3QNG1 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm6408J3QNG1 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm6408J3QNG1 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm6408J3QNG1 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm6408J3QNG1 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm6408J3QNG1 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm6408J3QNG1 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm6408J3QNG1 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm6408J3QNG1 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm6408J3QNG1 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm6408J3QNG1 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm6408J3QNG1 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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