Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm20828J3KMI7 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm20828J3KMI7 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm20828J3KMI7 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm20828J3KMI7 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm20828J3KMI7 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm20828J3KMI7 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm20828J3KMI7 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm20828J3KMI7 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm20828J3KMI7 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm20828J3KMI7 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm20828J3KMI7 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm20828J3KMI7 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm20828J3KMI7 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm20828J3KMI7 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm20828J3KMI7 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm20828J3KMI7 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm20828J3KMI7 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm20828J3KMI7 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm20828J3KMI7 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm20828J3KMI7 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm20828J3KMI7 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm20828J3KMI7 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm20828J3KMI7 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm20828J3KMI7 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm20828J3KMI7 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm20828J3KMI7 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm20828J3KMI7 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm20828J3KMI7 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm20828J3KMI7 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm20828J3KMI7 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm20828J3KMI7 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm20828J3KMI7 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm20828J3KMI7 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm20828J3KMI7 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm20828J3KMI7 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm20828J3KMI7 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm20828J3KMI7 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm20828J3KMI7 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm20828J3KMI7 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm20828J3KMI7 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm20828J3KMI7 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm20828J3KMI7 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm20828J3KMI7 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm20828J3KMI7 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm20828J3KMI7 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm20828J3KMI7 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm20828J3KMI7 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm20828J3KMI7 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm20828J3KMI7 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm20828J3KMI7 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm20828J3KMI7 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm20828J3KMI7 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm20828J3KMI7 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm20828J3KMI7 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm20828J3KMI7 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm20828J3KMI7 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm20828J3KMI7 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm20828J3KMI7 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm20828J3KMI7 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm20828J3KMI7 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm20828J3KMI7 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm20828J3KMI7 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm20828J3KMI7 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm20828J3KMI7 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm20828J3KMI7 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm20828J3KMI7 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm20828J3KMI7 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm20828J3KMI7 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm20828J3KMI7 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Gm20828J3KMI7 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Gm20828J3KMI7 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
Gm20828J3KMI7 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm20828J3KMI7 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm20828J3KMI7 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm20828J3KMI7 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm20828J3KMI7 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm20828J3KMI7 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm20828J3KMI7 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm20828J3KMI7 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm20828J3KMI7 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm20828J3KMI7 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm20828J3KMI7 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm20828J3KMI7 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm20828J3KMI7 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm20828J3KMI7 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm20828J3KMI7 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm20828J3KMI7 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm20828J3KMI7 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm20828J3KMI7 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm20828J3KMI7 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm20828J3KMI7 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm20828J3KMI7 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm20828J3KMI7 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm20828J3KMI7 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm20828J3KMI7 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm20828J3KMI7 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm20828J3KMI7 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm20828J3KMI7 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm20828J3KMI7 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.3 ms