Protein–RNA interactions for Protein: F6VRN1

Smgc, Submandibular gland protein C (Fragment), mousemouse

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmgcF6VRN1 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SmgcF6VRN1 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SmgcF6VRN1 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SmgcF6VRN1 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SmgcF6VRN1 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SmgcF6VRN1 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SmgcF6VRN1 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SmgcF6VRN1 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SmgcF6VRN1 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SmgcF6VRN1 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SmgcF6VRN1 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SmgcF6VRN1 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SmgcF6VRN1 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SmgcF6VRN1 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SmgcF6VRN1 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SmgcF6VRN1 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SmgcF6VRN1 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SmgcF6VRN1 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SmgcF6VRN1 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SmgcF6VRN1 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SmgcF6VRN1 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SmgcF6VRN1 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SmgcF6VRN1 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SmgcF6VRN1 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SmgcF6VRN1 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SmgcF6VRN1 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SmgcF6VRN1 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SmgcF6VRN1 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SmgcF6VRN1 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SmgcF6VRN1 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SmgcF6VRN1 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SmgcF6VRN1 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SmgcF6VRN1 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SmgcF6VRN1 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SmgcF6VRN1 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SmgcF6VRN1 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SmgcF6VRN1 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SmgcF6VRN1 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SmgcF6VRN1 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SmgcF6VRN1 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SmgcF6VRN1 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SmgcF6VRN1 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SmgcF6VRN1 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SmgcF6VRN1 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
SmgcF6VRN1 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SmgcF6VRN1 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SmgcF6VRN1 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SmgcF6VRN1 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SmgcF6VRN1 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SmgcF6VRN1 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SmgcF6VRN1 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SmgcF6VRN1 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SmgcF6VRN1 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SmgcF6VRN1 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SmgcF6VRN1 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SmgcF6VRN1 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SmgcF6VRN1 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SmgcF6VRN1 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SmgcF6VRN1 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SmgcF6VRN1 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SmgcF6VRN1 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SmgcF6VRN1 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SmgcF6VRN1 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SmgcF6VRN1 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SmgcF6VRN1 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SmgcF6VRN1 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SmgcF6VRN1 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SmgcF6VRN1 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SmgcF6VRN1 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SmgcF6VRN1 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SmgcF6VRN1 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SmgcF6VRN1 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SmgcF6VRN1 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SmgcF6VRN1 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SmgcF6VRN1 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SmgcF6VRN1 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SmgcF6VRN1 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SmgcF6VRN1 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SmgcF6VRN1 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SmgcF6VRN1 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SmgcF6VRN1 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SmgcF6VRN1 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SmgcF6VRN1 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SmgcF6VRN1 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SmgcF6VRN1 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SmgcF6VRN1 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SmgcF6VRN1 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SmgcF6VRN1 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SmgcF6VRN1 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SmgcF6VRN1 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SmgcF6VRN1 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SmgcF6VRN1 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SmgcF6VRN1 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SmgcF6VRN1 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SmgcF6VRN1 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SmgcF6VRN1 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SmgcF6VRN1 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SmgcF6VRN1 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SmgcF6VRN1 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SmgcF6VRN1 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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