Protein–RNA interactions for Protein: E9Q8F9

6030445D17Rik, RIKEN cDNA 6030445D17 gene, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6030445D17RikE9Q8F9 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
6030445D17RikE9Q8F9 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
6030445D17RikE9Q8F9 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
6030445D17RikE9Q8F9 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
6030445D17RikE9Q8F9 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
6030445D17RikE9Q8F9 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
6030445D17RikE9Q8F9 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
6030445D17RikE9Q8F9 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
6030445D17RikE9Q8F9 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
6030445D17RikE9Q8F9 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
6030445D17RikE9Q8F9 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
6030445D17RikE9Q8F9 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
6030445D17RikE9Q8F9 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
6030445D17RikE9Q8F9 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
6030445D17RikE9Q8F9 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
6030445D17RikE9Q8F9 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
6030445D17RikE9Q8F9 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
6030445D17RikE9Q8F9 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
6030445D17RikE9Q8F9 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
6030445D17RikE9Q8F9 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
6030445D17RikE9Q8F9 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
6030445D17RikE9Q8F9 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
6030445D17RikE9Q8F9 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
6030445D17RikE9Q8F9 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
6030445D17RikE9Q8F9 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
6030445D17RikE9Q8F9 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
6030445D17RikE9Q8F9 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
6030445D17RikE9Q8F9 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
6030445D17RikE9Q8F9 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
6030445D17RikE9Q8F9 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
6030445D17RikE9Q8F9 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
6030445D17RikE9Q8F9 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
6030445D17RikE9Q8F9 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
6030445D17RikE9Q8F9 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
6030445D17RikE9Q8F9 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
6030445D17RikE9Q8F9 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
6030445D17RikE9Q8F9 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
6030445D17RikE9Q8F9 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
6030445D17RikE9Q8F9 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
6030445D17RikE9Q8F9 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
6030445D17RikE9Q8F9 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
6030445D17RikE9Q8F9 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
6030445D17RikE9Q8F9 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
6030445D17RikE9Q8F9 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
6030445D17RikE9Q8F9 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
6030445D17RikE9Q8F9 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
6030445D17RikE9Q8F9 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
6030445D17RikE9Q8F9 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
6030445D17RikE9Q8F9 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
6030445D17RikE9Q8F9 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
6030445D17RikE9Q8F9 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
6030445D17RikE9Q8F9 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
6030445D17RikE9Q8F9 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
6030445D17RikE9Q8F9 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
6030445D17RikE9Q8F9 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
6030445D17RikE9Q8F9 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
6030445D17RikE9Q8F9 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
6030445D17RikE9Q8F9 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
6030445D17RikE9Q8F9 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
6030445D17RikE9Q8F9 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
6030445D17RikE9Q8F9 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
6030445D17RikE9Q8F9 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
6030445D17RikE9Q8F9 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
6030445D17RikE9Q8F9 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
6030445D17RikE9Q8F9 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
6030445D17RikE9Q8F9 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
6030445D17RikE9Q8F9 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
6030445D17RikE9Q8F9 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
6030445D17RikE9Q8F9 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
6030445D17RikE9Q8F9 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
6030445D17RikE9Q8F9 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
6030445D17RikE9Q8F9 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
6030445D17RikE9Q8F9 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
6030445D17RikE9Q8F9 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
6030445D17RikE9Q8F9 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
6030445D17RikE9Q8F9 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
6030445D17RikE9Q8F9 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
6030445D17RikE9Q8F9 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
6030445D17RikE9Q8F9 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
6030445D17RikE9Q8F9 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
6030445D17RikE9Q8F9 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
6030445D17RikE9Q8F9 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
6030445D17RikE9Q8F9 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
6030445D17RikE9Q8F9 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
6030445D17RikE9Q8F9 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
6030445D17RikE9Q8F9 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
6030445D17RikE9Q8F9 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
6030445D17RikE9Q8F9 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
6030445D17RikE9Q8F9 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
6030445D17RikE9Q8F9 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
6030445D17RikE9Q8F9 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
6030445D17RikE9Q8F9 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
6030445D17RikE9Q8F9 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
6030445D17RikE9Q8F9 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
6030445D17RikE9Q8F9 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
6030445D17RikE9Q8F9 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
6030445D17RikE9Q8F9 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
6030445D17RikE9Q8F9 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
6030445D17RikE9Q8F9 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
6030445D17RikE9Q8F9 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.9 ms