Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7L1

Urb2, URB2 ribosome biogenesis 2 homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb2E9Q7L1 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Urb2E9Q7L1 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Urb2E9Q7L1 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Urb2E9Q7L1 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Urb2E9Q7L1 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Urb2E9Q7L1 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Urb2E9Q7L1 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Urb2E9Q7L1 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Urb2E9Q7L1 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Urb2E9Q7L1 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Urb2E9Q7L1 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Urb2E9Q7L1 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Urb2E9Q7L1 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Urb2E9Q7L1 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Urb2E9Q7L1 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Urb2E9Q7L1 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Urb2E9Q7L1 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Urb2E9Q7L1 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Urb2E9Q7L1 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Urb2E9Q7L1 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Urb2E9Q7L1 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Urb2E9Q7L1 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Urb2E9Q7L1 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Urb2E9Q7L1 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Urb2E9Q7L1 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Urb2E9Q7L1 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Urb2E9Q7L1 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Urb2E9Q7L1 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Urb2E9Q7L1 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Urb2E9Q7L1 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Urb2E9Q7L1 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Urb2E9Q7L1 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Urb2E9Q7L1 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Urb2E9Q7L1 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Urb2E9Q7L1 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Urb2E9Q7L1 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Urb2E9Q7L1 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Urb2E9Q7L1 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Urb2E9Q7L1 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Urb2E9Q7L1 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Urb2E9Q7L1 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Urb2E9Q7L1 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Urb2E9Q7L1 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Urb2E9Q7L1 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Urb2E9Q7L1 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Urb2E9Q7L1 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Urb2E9Q7L1 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Urb2E9Q7L1 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Urb2E9Q7L1 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Urb2E9Q7L1 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Urb2E9Q7L1 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Urb2E9Q7L1 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Urb2E9Q7L1 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Urb2E9Q7L1 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Urb2E9Q7L1 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Urb2E9Q7L1 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Urb2E9Q7L1 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Urb2E9Q7L1 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Urb2E9Q7L1 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Urb2E9Q7L1 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Urb2E9Q7L1 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Urb2E9Q7L1 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Urb2E9Q7L1 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Urb2E9Q7L1 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Urb2E9Q7L1 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Urb2E9Q7L1 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Urb2E9Q7L1 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Urb2E9Q7L1 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Urb2E9Q7L1 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Urb2E9Q7L1 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Urb2E9Q7L1 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Urb2E9Q7L1 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Urb2E9Q7L1 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Urb2E9Q7L1 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Urb2E9Q7L1 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Urb2E9Q7L1 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Urb2E9Q7L1 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Urb2E9Q7L1 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Urb2E9Q7L1 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Urb2E9Q7L1 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Urb2E9Q7L1 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Urb2E9Q7L1 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Urb2E9Q7L1 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Urb2E9Q7L1 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Urb2E9Q7L1 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Urb2E9Q7L1 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Urb2E9Q7L1 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Urb2E9Q7L1 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Urb2E9Q7L1 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Urb2E9Q7L1 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Urb2E9Q7L1 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Urb2E9Q7L1 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Urb2E9Q7L1 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Urb2E9Q7L1 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Urb2E9Q7L1 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Urb2E9Q7L1 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Urb2E9Q7L1 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Urb2E9Q7L1 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Urb2E9Q7L1 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Urb2E9Q7L1 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms