Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M3

Gm3250, Predicted gene 3250, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3250E9Q1M3 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3250E9Q1M3 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3250E9Q1M3 Gm19990-201ENSMUST00000219468 1224 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3250E9Q1M3 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3250E9Q1M3 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3250E9Q1M3 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3250E9Q1M3 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3250E9Q1M3 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3250E9Q1M3 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3250E9Q1M3 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3250E9Q1M3 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3250E9Q1M3 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3250E9Q1M3 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3250E9Q1M3 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3250E9Q1M3 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3250E9Q1M3 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3250E9Q1M3 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3250E9Q1M3 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm3250E9Q1M3 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm3250E9Q1M3 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm3250E9Q1M3 5033425B01Rik-201ENSMUST00000213948 1303 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm3250E9Q1M3 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm3250E9Q1M3 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm3250E9Q1M3 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm3250E9Q1M3 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm3250E9Q1M3 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm3250E9Q1M3 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm3250E9Q1M3 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm3250E9Q1M3 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm3250E9Q1M3 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm3250E9Q1M3 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm3250E9Q1M3 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm3250E9Q1M3 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm3250E9Q1M3 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm3250E9Q1M3 Pid1-205ENSMUST00000176720 450 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm3250E9Q1M3 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm3250E9Q1M3 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm3250E9Q1M3 Gm37809-201ENSMUST00000195050 931 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm3250E9Q1M3 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm3250E9Q1M3 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm3250E9Q1M3 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm3250E9Q1M3 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm3250E9Q1M3 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm3250E9Q1M3 Gm25131-201ENSMUST00000082653 151 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm3250E9Q1M3 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm3250E9Q1M3 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm3250E9Q1M3 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm3250E9Q1M3 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm3250E9Q1M3 Mterf1a-201ENSMUST00000044746 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm3250E9Q1M3 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm3250E9Q1M3 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm3250E9Q1M3 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm3250E9Q1M3 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm3250E9Q1M3 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm3250E9Q1M3 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm3250E9Q1M3 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm3250E9Q1M3 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm3250E9Q1M3 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm3250E9Q1M3 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm3250E9Q1M3 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm3250E9Q1M3 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm3250E9Q1M3 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm3250E9Q1M3 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm3250E9Q1M3 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm3250E9Q1M3 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm3250E9Q1M3 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm3250E9Q1M3 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm3250E9Q1M3 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm3250E9Q1M3 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm3250E9Q1M3 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm3250E9Q1M3 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm3250E9Q1M3 Hsd11b1-203ENSMUST00000160929 1256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm3250E9Q1M3 Pantr1-211ENSMUST00000186656 647 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm3250E9Q1M3 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm3250E9Q1M3 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm3250E9Q1M3 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm3250E9Q1M3 AC106830.1-201ENSMUST00000228032 1003 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm3250E9Q1M3 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm3250E9Q1M3 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm3250E9Q1M3 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm3250E9Q1M3 Rnf212-201ENSMUST00000068946 288 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm3250E9Q1M3 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm3250E9Q1M3 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm3250E9Q1M3 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm3250E9Q1M3 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm3250E9Q1M3 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm3250E9Q1M3 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm3250E9Q1M3 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm3250E9Q1M3 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm3250E9Q1M3 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm3250E9Q1M3 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm3250E9Q1M3 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm3250E9Q1M3 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm3250E9Q1M3 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm3250E9Q1M3 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm3250E9Q1M3 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm3250E9Q1M3 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm3250E9Q1M3 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm3250E9Q1M3 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm3250E9Q1M3 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms