Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fndc1E9Q043 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fndc1E9Q043 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fndc1E9Q043 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fndc1E9Q043 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fndc1E9Q043 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Fndc1E9Q043 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fndc1E9Q043 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fndc1E9Q043 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fndc1E9Q043 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fndc1E9Q043 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fndc1E9Q043 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fndc1E9Q043 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fndc1E9Q043 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fndc1E9Q043 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Fndc1E9Q043 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Fndc1E9Q043 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fndc1E9Q043 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fndc1E9Q043 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fndc1E9Q043 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fndc1E9Q043 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fndc1E9Q043 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fndc1E9Q043 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fndc1E9Q043 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Fndc1E9Q043 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fndc1E9Q043 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fndc1E9Q043 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fndc1E9Q043 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fndc1E9Q043 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fndc1E9Q043 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fndc1E9Q043 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fndc1E9Q043 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fndc1E9Q043 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fndc1E9Q043 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fndc1E9Q043 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fndc1E9Q043 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fndc1E9Q043 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fndc1E9Q043 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fndc1E9Q043 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Fndc1E9Q043 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fndc1E9Q043 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fndc1E9Q043 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Fndc1E9Q043 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fndc1E9Q043 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fndc1E9Q043 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Fndc1E9Q043 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fndc1E9Q043 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fndc1E9Q043 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fndc1E9Q043 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fndc1E9Q043 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fndc1E9Q043 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fndc1E9Q043 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Fndc1E9Q043 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fndc1E9Q043 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fndc1E9Q043 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fndc1E9Q043 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fndc1E9Q043 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fndc1E9Q043 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fndc1E9Q043 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fndc1E9Q043 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fndc1E9Q043 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Fndc1E9Q043 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fndc1E9Q043 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fndc1E9Q043 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fndc1E9Q043 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fndc1E9Q043 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fndc1E9Q043 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fndc1E9Q043 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Fndc1E9Q043 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fndc1E9Q043 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Fndc1E9Q043 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Fndc1E9Q043 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fndc1E9Q043 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fndc1E9Q043 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Fndc1E9Q043 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fndc1E9Q043 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fndc1E9Q043 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fndc1E9Q043 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fndc1E9Q043 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Fndc1E9Q043 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fndc1E9Q043 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fndc1E9Q043 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fndc1E9Q043 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fndc1E9Q043 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fndc1E9Q043 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fndc1E9Q043 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Fndc1E9Q043 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fndc1E9Q043 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fndc1E9Q043 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fndc1E9Q043 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fndc1E9Q043 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fndc1E9Q043 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fndc1E9Q043 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fndc1E9Q043 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fndc1E9Q043 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fndc1E9Q043 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fndc1E9Q043 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Fndc1E9Q043 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fndc1E9Q043 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fndc1E9Q043 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms