Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB5

Ttc17, Tetratricopeptide repeat protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc17E9PVB5 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttc17E9PVB5 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttc17E9PVB5 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttc17E9PVB5 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttc17E9PVB5 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttc17E9PVB5 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttc17E9PVB5 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttc17E9PVB5 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttc17E9PVB5 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttc17E9PVB5 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttc17E9PVB5 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttc17E9PVB5 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttc17E9PVB5 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttc17E9PVB5 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttc17E9PVB5 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttc17E9PVB5 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttc17E9PVB5 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttc17E9PVB5 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttc17E9PVB5 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttc17E9PVB5 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttc17E9PVB5 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttc17E9PVB5 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttc17E9PVB5 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttc17E9PVB5 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttc17E9PVB5 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttc17E9PVB5 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttc17E9PVB5 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttc17E9PVB5 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ttc17E9PVB5 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ttc17E9PVB5 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ttc17E9PVB5 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ttc17E9PVB5 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ttc17E9PVB5 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ttc17E9PVB5 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ttc17E9PVB5 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ttc17E9PVB5 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ttc17E9PVB5 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ttc17E9PVB5 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ttc17E9PVB5 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ttc17E9PVB5 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ttc17E9PVB5 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ttc17E9PVB5 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ttc17E9PVB5 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ttc17E9PVB5 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ttc17E9PVB5 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ttc17E9PVB5 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ttc17E9PVB5 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ttc17E9PVB5 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ttc17E9PVB5 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ttc17E9PVB5 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ttc17E9PVB5 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ttc17E9PVB5 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ttc17E9PVB5 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ttc17E9PVB5 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ttc17E9PVB5 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ttc17E9PVB5 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ttc17E9PVB5 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ttc17E9PVB5 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ttc17E9PVB5 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ttc17E9PVB5 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ttc17E9PVB5 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ttc17E9PVB5 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ttc17E9PVB5 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ttc17E9PVB5 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ttc17E9PVB5 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ttc17E9PVB5 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ttc17E9PVB5 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ttc17E9PVB5 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ttc17E9PVB5 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ttc17E9PVB5 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ttc17E9PVB5 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ttc17E9PVB5 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ttc17E9PVB5 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ttc17E9PVB5 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ttc17E9PVB5 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ttc17E9PVB5 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ttc17E9PVB5 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ttc17E9PVB5 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ttc17E9PVB5 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ttc17E9PVB5 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ttc17E9PVB5 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ttc17E9PVB5 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ttc17E9PVB5 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ttc17E9PVB5 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ttc17E9PVB5 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ttc17E9PVB5 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ttc17E9PVB5 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ttc17E9PVB5 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ttc17E9PVB5 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ttc17E9PVB5 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ttc17E9PVB5 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ttc17E9PVB5 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ttc17E9PVB5 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ttc17E9PVB5 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ttc17E9PVB5 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ttc17E9PVB5 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ttc17E9PVB5 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ttc17E9PVB5 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ttc17E9PVB5 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ttc17E9PVB5 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms