Protein–RNA interactions for Protein: E9PV24

Fga, Fibrinogen alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 789 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgaE9PV24 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FgaE9PV24 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FgaE9PV24 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FgaE9PV24 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FgaE9PV24 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FgaE9PV24 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FgaE9PV24 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FgaE9PV24 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FgaE9PV24 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FgaE9PV24 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FgaE9PV24 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FgaE9PV24 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FgaE9PV24 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FgaE9PV24 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FgaE9PV24 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FgaE9PV24 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FgaE9PV24 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FgaE9PV24 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FgaE9PV24 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FgaE9PV24 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FgaE9PV24 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FgaE9PV24 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FgaE9PV24 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FgaE9PV24 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FgaE9PV24 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FgaE9PV24 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FgaE9PV24 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FgaE9PV24 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FgaE9PV24 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FgaE9PV24 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FgaE9PV24 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FgaE9PV24 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FgaE9PV24 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FgaE9PV24 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FgaE9PV24 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FgaE9PV24 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FgaE9PV24 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FgaE9PV24 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FgaE9PV24 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FgaE9PV24 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FgaE9PV24 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FgaE9PV24 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FgaE9PV24 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FgaE9PV24 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FgaE9PV24 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FgaE9PV24 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FgaE9PV24 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FgaE9PV24 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FgaE9PV24 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FgaE9PV24 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FgaE9PV24 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FgaE9PV24 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FgaE9PV24 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FgaE9PV24 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FgaE9PV24 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FgaE9PV24 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FgaE9PV24 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FgaE9PV24 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FgaE9PV24 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FgaE9PV24 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FgaE9PV24 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FgaE9PV24 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FgaE9PV24 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FgaE9PV24 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FgaE9PV24 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FgaE9PV24 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FgaE9PV24 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FgaE9PV24 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FgaE9PV24 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FgaE9PV24 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FgaE9PV24 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FgaE9PV24 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FgaE9PV24 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FgaE9PV24 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FgaE9PV24 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FgaE9PV24 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FgaE9PV24 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FgaE9PV24 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FgaE9PV24 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FgaE9PV24 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FgaE9PV24 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FgaE9PV24 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FgaE9PV24 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FgaE9PV24 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FgaE9PV24 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FgaE9PV24 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FgaE9PV24 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FgaE9PV24 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FgaE9PV24 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FgaE9PV24 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
FgaE9PV24 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FgaE9PV24 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FgaE9PV24 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FgaE9PV24 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FgaE9PV24 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FgaE9PV24 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
FgaE9PV24 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
FgaE9PV24 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
FgaE9PV24 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
FgaE9PV24 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms