Protein–RNA interactions for Protein: E0CZ16

Klhl3, Kelch-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl3E0CZ16 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klhl3E0CZ16 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klhl3E0CZ16 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klhl3E0CZ16 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klhl3E0CZ16 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klhl3E0CZ16 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klhl3E0CZ16 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klhl3E0CZ16 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klhl3E0CZ16 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klhl3E0CZ16 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klhl3E0CZ16 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klhl3E0CZ16 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klhl3E0CZ16 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klhl3E0CZ16 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klhl3E0CZ16 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klhl3E0CZ16 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klhl3E0CZ16 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klhl3E0CZ16 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klhl3E0CZ16 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klhl3E0CZ16 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klhl3E0CZ16 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klhl3E0CZ16 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klhl3E0CZ16 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klhl3E0CZ16 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klhl3E0CZ16 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klhl3E0CZ16 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klhl3E0CZ16 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klhl3E0CZ16 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klhl3E0CZ16 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klhl3E0CZ16 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klhl3E0CZ16 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klhl3E0CZ16 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klhl3E0CZ16 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klhl3E0CZ16 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klhl3E0CZ16 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klhl3E0CZ16 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klhl3E0CZ16 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klhl3E0CZ16 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klhl3E0CZ16 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klhl3E0CZ16 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klhl3E0CZ16 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klhl3E0CZ16 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klhl3E0CZ16 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klhl3E0CZ16 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klhl3E0CZ16 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klhl3E0CZ16 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klhl3E0CZ16 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klhl3E0CZ16 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klhl3E0CZ16 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klhl3E0CZ16 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klhl3E0CZ16 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klhl3E0CZ16 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klhl3E0CZ16 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klhl3E0CZ16 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Klhl3E0CZ16 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klhl3E0CZ16 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klhl3E0CZ16 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klhl3E0CZ16 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klhl3E0CZ16 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klhl3E0CZ16 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klhl3E0CZ16 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klhl3E0CZ16 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klhl3E0CZ16 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klhl3E0CZ16 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klhl3E0CZ16 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klhl3E0CZ16 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klhl3E0CZ16 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Klhl3E0CZ16 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Klhl3E0CZ16 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Klhl3E0CZ16 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Klhl3E0CZ16 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Klhl3E0CZ16 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Klhl3E0CZ16 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Klhl3E0CZ16 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Klhl3E0CZ16 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Klhl3E0CZ16 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Klhl3E0CZ16 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Klhl3E0CZ16 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Klhl3E0CZ16 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Klhl3E0CZ16 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Klhl3E0CZ16 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Klhl3E0CZ16 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Klhl3E0CZ16 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Klhl3E0CZ16 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Klhl3E0CZ16 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Klhl3E0CZ16 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Klhl3E0CZ16 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Klhl3E0CZ16 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Klhl3E0CZ16 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klhl3E0CZ16 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klhl3E0CZ16 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klhl3E0CZ16 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klhl3E0CZ16 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klhl3E0CZ16 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klhl3E0CZ16 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klhl3E0CZ16 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klhl3E0CZ16 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klhl3E0CZ16 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Klhl3E0CZ16 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klhl3E0CZ16 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms